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《一个快速响应干旱的f-box基因的克隆和表达分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(6):1027−1034http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.01027一个快速响应干旱的F-box基因的克隆和表达分析∗尹恒余琴鸯安利佳李文利大连理工大学生命科学与技术学院,辽宁大连116024摘要:F-box是Skp1-Cullin1-F-box(SCF)型泛素连接酶E3的重要
2、组成部分,在泛素化介导的蛋白质降解中选择性识别靶蛋白。本文从谷子苗期干旱胁迫条件下构建的转录组文库中克隆了与耐旱早期响应相关的F-box基因,命名为SiFBX(GenBank登录号为KC252635.1)。该基因全长510bp,编码170个氨基酸。蛋白质结构预测表明,该蛋白含有丰富的精氨酸、亮氨酸、丝氨酸,缺少跨膜结构域及信号肽序列。系统进化分析表明,该基因与已报道的EID1和FBW4亲缘关系较近。在该基因上游1.9kb序列处,预测到启动子的核心序列及与多种逆境胁迫相关的调控序列。荧光定量PCR分析表明,该基因分别在正常干
3、旱、PEG和ABA诱导下,表达量出现显著变化。关键词:谷子;干旱响应;F-box;gRT-PCRCloningandExpressionAnalysisofanF-boxGene(SiFBX)RapidlyRespon-sivetoDroughtStress*YINHeng,YUQin-Yang,ANLi-Jia,andLIWen-LiSchoolofLifeScience&Biotechnology,DalianUniversityofTechnology,Dalian116024,ChinaAbstract:F-box
4、proteins,componentsoftheSkp1-Cullin1-F-box(SCF)proteinE3ubiquitinligasecomplex,serveasthevariablecomponentresponsibleforsubstraterecognitionandrecruitmentinSCF-mediatedproteolysis.Theanti-droughtrelativegeneofSiFBX(GenBankaccessionnumberKC252635.1)whichbelongstoth
5、eF-boxsuperfamilywasclonedfromfoxtailmillet(Se-tariaitalic).Thefull-lengthcDNAofSiFBXwas510bp,whichencoded170aminoacidresidues.Proteinanalysisandstructurepredicationshowedthatithasahigherproportionofarginine(R),leucine(L),andserine(S)andalackoftrans-membranedo-mai
6、nsandsignalpeptide.PhylogeneticanalysisdemonstratedthatSiFBXhassimilaritywithEID1andFBW4.Manyabioticstress-relatedcis-actingelementsandtranscriptionfactorswerediscoveredinthe1.9kbupstreamregionofSiFBX.Theresultsofreal-timePCRshowedthattherewereremarkablechangesint
7、heexpectationlevelofSiFBXforthetreatmentswithPEG,wa-ter-withholding,andABA.Keywords:Setariaitalica;Droughtresponse;F-boxprotein;qRT-PCR研究表明,泛素化蛋白连接酶E3对植物生长发构域的下游,常常伴随一些重要的次级元件,如育和逆境胁迫响应等过程中的关键步骤具有重要的LRR(leucine-richrepeat)、WDrepeat、亮氨酸拉链[1][2]调控作用,Skp1-Cullin1-F-b
8、ox(SCF)型蛋白复合物结构等。[3]是E3中研究最深入的一类。F-box蛋白也是真核细Shinozaki等首先在拟南芥基因组序列中发现胞中一大类蛋白质家族,包含了一个35~60个氨基了近700个编码F-box蛋白的基因,占基因组编码总[4]酸组成的F-box结构域,在SCF型E3介导的蛋白降蛋白的3
