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《colo205来源的大肠癌始动细胞锌指蛋白表达谱变化分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、Colo205来源的大肠癌始动细胞锌指蛋白表达谱变化分析岳昌武1,Δ,★,吕玉红2,★,周昕3,王苗1,曾庆良3,李园园1,邵美云1(1.遵义医学院医学与生物学研究中心,贵州遵义563003;2.遵义医学院基础医学院组胚教研室,贵州遵义563003;3.遵义医学院附属医院胃肠外科,贵州遵义563003)摘要:目的获得大肠癌始动细胞群锌指蛋白表达谱变化信息,为后续始动细胞生物学特性研究提供表观遗传学依据。方法采用无血清悬浮培养结合CD133抗体标记磁珠分选获得Colo205来源大肠癌始动细胞,高通量测序分析180个锌指蛋白基因mR
2、NA表达谱变化。结果与CD133-和Colo205细胞群相比,CD133+细胞群中的180个锌指蛋白基因在mRNA水平上有35个基因发生显著地表达改变。结论无血清培养基培养结合CD133磁珠分选Colo205细胞获得的CD133+细胞亚群锌指蛋白基因表达发生显著改变,可用于后续大肠癌生物学特性研究。关键词大肠癌始动细胞,锌指蛋白,基因差异表达分析Differentialexpressionprofileofzincfingergenesincolorectalcancercellsofcolorectalcancercellsd
3、erivedfromcolo205ChangwuYUE,YuhongLÜ,XinZHOU.etal.(Researchcentreformedicineandbiology,Zunyimedicalcollege,Zunyi,Guizhou,563003)Abstract:ObjectiveToobtaindifferentialexpressioninformationofzincfingerproteinfromcolorectalcancerinitiatingcellsderivedfromcolo205.Methods
4、Differentialexpressionprofileof180zincfingerproteingeneswereanalyzedbythetechnologyofsecond-generationsequencinginCD133+,CD133-colorectalcancercellsfromColo205cellsisolatedbylCD133immuno-magneticbeads.Results35zincfingerproteingenesexpressionlevelswerechangedinCD133+
5、cellscomparedwithCD133-andColo205cells.ConclusionsTherealotofdifferentialgenesincolo205cells,sortedCD133+cellsandCD133-cellscanbeusedforfurtherresearchoftheirbiologicalbehavior.Keywords:Colorectalcancer;genesexpressionprofile;zincfingerprotein*基金项目:贵州省社会发展科技攻关计划(黔科合S
6、Y字[2009]3068)作者单位:1.贵州省遵义市遵义医学院医学与生物学研究中心,贵州遵义,563003;2.遵义医学院基础医学院组胚教研室,贵州遵义,563003;3.贵州省遵义市遵义医学院附属医院胃肠外科贵州遵义,563003。作者简介:岳昌武(1975-),男,副研究员&副教授,硕士生导师,从事医学分子生物学研究;吕玉红(1976-),女,硕士,讲师,从事医学分子生物学研究;曾庆良(1957-),男,硕士生导师,教授,从事大肠癌外科手术治疗及发病机制研究。Δ通讯作者,贵州省遵义市大连路201号,E-mail:changw
7、uyue@126.com;★该作者对本文贡献相同。1.前言锌指蛋白是指含有通过结合2价锌离子稳定的短的可以自我折叠形成“手指”结构一类蛋白质,通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合,以及与自身或其他锌指蛋白的结合,在转录和翻译水平上调控基因的表达,在基因的表达调控、细胞分化、胚胎发育等生命过程中发挥重要作用[1]。近年来研究发现,锌指蛋白和癌症的发生、发展及转移有着密切的联系,例如正常生理状态下,部分KRAB型锌指蛋白参与参与肿瘤发生、发展的调控的负调控;当机体受到外界因素影响发生肿瘤及肿瘤进一步发展过程中,
8、部分KRAB型锌指蛋白也可以参与DNA损伤修复,避免肿瘤发生或通过抑制细胞增殖和诱导细胞凋亡两种途径来抑制肿瘤细胞生长[2];最新研究表明,锌指蛋白也可能参与到癌症的转移的生物学进程[3]。大肠癌(colorectalcancer)是目前国内发病率次仅于肺癌、乳