ibp表达抑制后活化t淋巴细胞基因表达谱变化分析

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1、IBP表达抑制后活化T淋巴细胞基因表达谱变化分析向莉，李鹏，张竹君，杨明珍，陈安，胡川闽（400038重庆，第三军医大学医学检验系临床生物化学教研室）［摘要］目的利用全基因组寡核苷酸芯片检测IBP表达抑制后活化T淋巴细胞基因表达谱的差异，为进一步研究IBP在T淋巴细胞中的作用奠定基础。方法采用本室构建的IBP表达抑制的JurkateT细胞及相应对照细胞为实验对象，Anti-CD3、CD28mAb处理细胞后提取刺激24h及48h的细胞总RNA，利用北京博奥生物有限公司22KHumanGenomeArray芯片检测基因表达的差异，以MAS.doc.V1软件，结合KEG

2、G、NCBI等生物信息学数据库检索分析差异表达基因功能和网络关系。结果芯片结果显示，IBP基因表达抑制的JurkatT细胞在TCR信号刺激24h和48h后，细胞能量代谢、周期生长、转录调控及凋亡等多种类型的基因发生差异表达改变，两个时相组共有56个差异表达趋势一致基因，其中17个基因共同上调，39个基因共同下调。结论通过基因芯片的筛选，提示在活化的JurkatT细胞中IBP表达抑制所致多个基因差异表达，这些基因的鉴定将有助于研究IBP的生物学功能。［关键词］IBP；T淋巴细胞；基因芯片［中图法分类号］R392.11［文献标志码］AGeneexpressionpro

3、fileofactivatedTlymphocytewithIBPdeficientbyoligonucleotidemicroarrayXiangLi,LiPeng,Zhangzhujun,Yangmingzhen,Chenan,HuChuanmin（DepartmentofClinicalBiochemistry,CollegeofMedicalLaboratory,ThirdMilitaryMedicalUniversity,Chongqing,400038,China请补充院系名称）[Abstract]英文摘要部分已作了部分修改，请作者核对Objectiv

4、e　ToinvestigatethedifferenceofgeneexpressionbetweenactivatedIBP-deficientandwildactivatedTlymphocytebyoligonucleotidemicroarrayandprovidebasisforfurtherstudyingthemechanismroleofIBPinTlymphocyteactivation.Methods　TotalRNAwasisolatedfromIBP-deficientanditsparentaljurkatTcellswithanti-C

5、D3andanti-CD28mAbstimulatedstimulation,andsynthesizedintodouble-strandedcDNA,thatwasthensynthesizedintobiotin-labeledcRNAprobebyinvitrotranscription.ThecRNAprobeswereseparatelyhybridizedwith22KHumanGenomeArrayChip,andthesignalswerescannedbytheGeneArrayScanner.Theresultswereanalyzedbyb

6、ioinformatics.Results　InCcomparedisonwiththegeneexpressionprofileofparentalJurkatTcells,17geneswereup-regulatedand39genesdown-regulatedinactivatedIBP-deficientactivatedJurkatTcells.AccordingtoGeneOntologyandTreeViewanalysis,thesegeneswereinvolvedinenergymetabolism,cellcycle,transcript

7、ionandapoptosisandsoon.Conclusion　ManydifferentialexpressiongenesinducedbythelostofIBPinJurkatTcellshavebeenscreenedbyhigh-throughputgenechipmethod.ValidatingtheirmolecularfunctionswillhelptoidentifythemechanismofhumanIBPinTlymphocytes.[Keywords]IBP；Tlymphocyte；genechipSupportedbytheG

8、enera