猪细小病毒sybr green i荧光定量pcr诊断试剂盒的研制

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1、猪细小病毒SYBRGreenI荧光定量PCR诊断试剂盒的研制余波,周思旋,谭诗文,徐景峨,史开志,杨莉(贵州省畜牧兽医研究所,贵阳550005)摘要:根据GenBank中猪细小病毒VP2基因序列设计特异性的引物,PCR扩增获得猪细小病毒VP2基因片段,并克隆到pMD-18T载体上作为阳性标准品。通过对SYBRGreenI荧光定量PCR反应条件的优化,建立了猪细小病毒的SYBRGreenI荧光定量PCR诊断方法,以此为基础研制出试剂盒。试剂盒扩增产物的熔解曲线分析只出现1个单特异峰,无引物二聚体,对PRV、PCV-2、E.coli、CSFV、PRRSV均无阳性信号扩增,可重复性好,测灵敏度可达1

2、.0×101拷贝/μL。结果表明,研制的猪细小病毒SYBRGreenI实时荧光定量PCR试剂盒具有特异、灵敏、快速、重复性好等优点,适合于猪细小病毒临床样品的检测。..关键词:猪细小病毒;VP2基因;SYBRGreenI荧光定量中图分类号:S852.65+9.1文献标识码:A:0439-8114(2015)01-0126-04DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.01.033DevelopingASYBRGreenIFluorescentQuantitativePCRKitforDetectingofPPVYUBo,ZHOUSi-xuan,TANShi-

3、wen,XUJing-e,SHIKai-zhi,YANGLi(GuizhouInstituteofAnimalHusbandryandVeterinaryMedicine,Guiyang550005,China)Abstract:BasedontheVP2genesequencesofPPVinGenBank,onepairsofspecificprimerwasdesignedforamplifyingthespecificfragmentsofVP2gene.TheamplifiedVP2geneofPPVwasclonedintopMD-18Tvectorandusedaspositiv

4、estandard.Afteroptimizingannealingtemperatureandprimersconcentrations,aSYBRGreenIfluorescentQuantitativePCRwasestablishedforsimultaneouslydetectingPPV.ThemeltingcurveanalysisusingSYBRGreenIdyeshowedonespecificpeak.Noprimer-dimerspeakwasobserved.NoamplificationwasamplifiedfromPRV,PCV-2,E.coli,CSFV,PR

5、RSVwiththeSYBRGreenIReal-timeQuantitativePCR.ThePCRkitwashighlysensitiveto1.0×101copies/μLDNA.ItisrevealedthattheSYBRGreenIReal-timeQuantitativePCRkitwassensitive,specificwithgoodrepetition.ItcouldbeusedtodetectPPVinclinicalsamples.Keywords:PPV;VP2gene;SYBRgreenIfluorescentquantitativePCR收稿日期:2014-0

6、9-29基金项目:贵州省农业攻关项目[黔科合NY字(2010)3085];贵州省畜禽健康养殖技术创新能力建设项目[黔科合院所创能(2010)4004]简介:余波(1981-),男,四川邻水人,副研究员,硕士,主要从事兽医分子生物学研究,()15085916661(电子信箱)yubonky@163.com;通信,谭诗文(1956-),男,研究员,主要从事兽医分子生物学研究,(电子信箱)swleiden@sina.com。猪细小病毒(Poreineparvovirus,PPV)是引起母猪繁殖障碍性疾病的主要病原体之一,可导致母猪流产、死胎,给养猪业造成了巨大的经济损失[1-3]。目前,对该病的诊断

7、方法包括传统的病毒分离鉴定,以及血清学诊断方法,如ELISA、胶体金等。常规的PCR主要用于病死猪组织样本的检测,然而PPV常呈长期低剂量隐性感染,常规的PCR不仅无法对血清样本中的病毒进行定量检测,而且扩增反应后需要电泳检测,操作繁琐。荧光定量PCR是与常规PCR比较,具有重复性好、灵敏度高、能够定量等优点,已经被广泛应用于多种疾病病原的检测[4,5]。本研究根据GenBank中猪细小病毒VP2

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