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1、2015-2016第二学期生物科学实验(植物基因克隆)实验总结班级:13级生物科学2班学号:1312022005姓名:邓伟强U期:2016年6刀10U一、实验原理及方法:实验原理:基因的克隆就是利用体外重组技术,将特定的基因和芄它DNA顺序插入到载体分子屮。基因克隆的主耍目标是识别、分离特异基因丼获得基因的完整的全序列,确定染色体定位,阐明基因的生化功能,明确其对特定性状的遗传控制关系。通过几十年的努力由于植物发育,生理生化,分+遗传等学科的迅速发展,使人们掌握了大量宥关植物优R性状基因的生物学和遗传学知识,再
2、运用先进的酶学和生物学技术已经克隆出了与植物抗病、抗虫、抗除草剂、抗逆,育性、高蛋白质及与楨物发育有关的许多基因。实验方法及过程:1.CTAB法提取水稻基因组DNA配制CTAB溶液:(2gCTAB,3.17gNacl,lmol/LTrisHcl10ml(PH8.0),EDTA4ml,最后定容至100ml.)配制TBE溶液:(24gTrisHcl,1.488gNa2EDTA.2H2O,llg硼酸,最后定容至200ml.)2.配置琼脂糖缓冲液:lOxTBEBuffer配制方法:每组需要:称量下列试剂,置于1L烧杯中
3、Tris:108gNa2EDTA-2H2O:7.44g硼酸:55g向烧杯中加入约800ml的无菌水,充分搅拌溶解。加无菌水将溶液定容至1L后,室温保存。用时稀释。2.开发设计引物LOC_Os02g42310Chromosome2:25,442,875-25,450,093OsSCPS-PutativeSerineCarboxypeptidasehomologue,expressedOryzasalivaJaponicaCX:ATATGTCAACATCTCArCrCCCiTarncrCTrrAGAAAAAAATC
4、AGAACGzGAGTAACAAAACACAACTAGAGfiACACATACATAT5、AGACG.VGAGriOryzaxafivabidicaGCGCCGGAGACGAAGAATTGzAGGGrrC.GA?AGTAACTAGCT?GnTGxn,CvTCTTTzGGAGA//GTrTG6、05.003.00ACTCTGGACCGTGCAAACTTLength:201japonica,193Indica3.PCR反应体系10x扩增缓冲液:每管:2ul共需:24uldNTP混合物:每管:0.8ul共需:9.6ul模板DNA:每管3ul,共需36ulTaqDNA聚合酶:每管0.3ul,共需3.6ul引物1、2:每管:2d(骱引物lul、肜引物lul)共需24ul。两种引物各6管。引物1、2代表的体系分别加火菌水71.4u侄120ul,分装6个ep管。4.PCR反应程序95°C预加热5分钟,95°C307、秒钟、56°C30秒钟>35循环72°C30秒钟72°C10分钟16°C5分钟总吋长:1小吋35分钟2.琼脂糖凝胶电泳制胶:称取1.6g琼脂糖于配好的160mlCTAB溶液(稀释10倍后的)中,在微波炉中加热溶解,冷却后,加入3ul的核酸染色剂(BE)。倒胶:插入梳子,摇匀之后倒胶(1LTBE缓冲液,淹没琼脂),避光静置大概20min。点胶:■直拔掉梳子,把凝好的胶取出來放在有与制胶同浓度TBE缓冲液的电泳槽中。在第一个胶孔中加入maker,作对比。上样:取2ulLOadingBfftier(—种沉淀剂,使点胶8、后样品沉到胶孔底部不浮上来)混匀10ul的DNA样品。用移液枪打入胶孔。电泳:电压电流(100V、100mA)跑40min。3.紫外灯下观察条带条带清晰一段说明含DNA多。4.切胶回收(1)切胶,然后加入胶的三倍体职的BufferGA(若小丁*300bp,按1:5)木组切下的三份胶均为0.15g,分别加入丫450ul的BufferGA(2)55度水浴10分钟,期间摇晃2〜3次(3)加入
5、AGACG.VGAGriOryzaxafivabidicaGCGCCGGAGACGAAGAATTGzAGGGrrC.GA?AGTAACTAGCT?GnTGxn,CvTCTTTzGGAGA//GTrTG6、05.003.00ACTCTGGACCGTGCAAACTTLength:201japonica,193Indica3.PCR反应体系10x扩增缓冲液:每管:2ul共需:24uldNTP混合物:每管:0.8ul共需:9.6ul模板DNA:每管3ul,共需36ulTaqDNA聚合酶:每管0.3ul,共需3.6ul引物1、2:每管:2d(骱引物lul、肜引物lul)共需24ul。两种引物各6管。引物1、2代表的体系分别加火菌水71.4u侄120ul,分装6个ep管。4.PCR反应程序95°C预加热5分钟,95°C307、秒钟、56°C30秒钟>35循环72°C30秒钟72°C10分钟16°C5分钟总吋长:1小吋35分钟2.琼脂糖凝胶电泳制胶:称取1.6g琼脂糖于配好的160mlCTAB溶液(稀释10倍后的)中,在微波炉中加热溶解,冷却后,加入3ul的核酸染色剂(BE)。倒胶:插入梳子,摇匀之后倒胶(1LTBE缓冲液,淹没琼脂),避光静置大概20min。点胶:■直拔掉梳子,把凝好的胶取出來放在有与制胶同浓度TBE缓冲液的电泳槽中。在第一个胶孔中加入maker,作对比。上样:取2ulLOadingBfftier(—种沉淀剂,使点胶8、后样品沉到胶孔底部不浮上来)混匀10ul的DNA样品。用移液枪打入胶孔。电泳:电压电流(100V、100mA)跑40min。3.紫外灯下观察条带条带清晰一段说明含DNA多。4.切胶回收(1)切胶,然后加入胶的三倍体职的BufferGA(若小丁*300bp,按1:5)木组切下的三份胶均为0.15g,分别加入丫450ul的BufferGA(2)55度水浴10分钟,期间摇晃2〜3次(3)加入
6、05.003.00ACTCTGGACCGTGCAAACTTLength:201japonica,193Indica3.PCR反应体系10x扩增缓冲液:每管:2ul共需:24uldNTP混合物:每管:0.8ul共需:9.6ul模板DNA:每管3ul,共需36ulTaqDNA聚合酶:每管0.3ul,共需3.6ul引物1、2:每管:2d(骱引物lul、肜引物lul)共需24ul。两种引物各6管。引物1、2代表的体系分别加火菌水71.4u侄120ul,分装6个ep管。4.PCR反应程序95°C预加热5分钟,95°C30
7、秒钟、56°C30秒钟>35循环72°C30秒钟72°C10分钟16°C5分钟总吋长:1小吋35分钟2.琼脂糖凝胶电泳制胶:称取1.6g琼脂糖于配好的160mlCTAB溶液(稀释10倍后的)中,在微波炉中加热溶解,冷却后,加入3ul的核酸染色剂(BE)。倒胶:插入梳子,摇匀之后倒胶(1LTBE缓冲液,淹没琼脂),避光静置大概20min。点胶:■直拔掉梳子,把凝好的胶取出來放在有与制胶同浓度TBE缓冲液的电泳槽中。在第一个胶孔中加入maker,作对比。上样:取2ulLOadingBfftier(—种沉淀剂,使点胶
8、后样品沉到胶孔底部不浮上来)混匀10ul的DNA样品。用移液枪打入胶孔。电泳:电压电流(100V、100mA)跑40min。3.紫外灯下观察条带条带清晰一段说明含DNA多。4.切胶回收(1)切胶,然后加入胶的三倍体职的BufferGA(若小丁*300bp,按1:5)木组切下的三份胶均为0.15g,分别加入丫450ul的BufferGA(2)55度水浴10分钟,期间摇晃2〜3次(3)加入
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