中国结核杆菌利福平耐药株rpob基因531、526、516位点碱基突变特点

《中国结核杆菌利福平耐药株rpob基因531、526、516位点碱基突变特点》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、中国结核杆菌利福平耐药株rpoB基因531、526、516位点碱基突变特点基金项目：广东省科技计划项目(编号：2011B318800377,2013B021800060)曹翌明孟繁荣刘志辉：广州市胸科医院广东广州510095李丽：茂名农垦医院广东茂名525200通讯：刘志辉中国结核杆菌利福平耐药株rpoB基因531、526、516位点碱基突变特点曹翌明李丽孟繁荣刘志辉BASEMUTATIONCHARACTERISTICSINTHEPOINTSOF531,526AND516OFRPOBGENEOFRIFAMPIC

2、IN-RESISTANTTUBERCULOSISBACILISTRAINSCAOYiMing,LIli,MENGFanrong,etal【摘要】目的深入了解中国结核杆菌利福平耐药株rpoB基因531、526、516三个高突变率发生位点的碱基突变特点，为全面理解结核杆菌利福平耐药机制提供科学依据。方法计算机检索PubMed数据库，对截止2015年3月31日发表的中国结核杆菌利福平耐药株rpoB基因突变研究的文献数据进行整合分析。结果纳入分析文献49篇，获得3319株利福平耐药结核杆菌rpoB基因各位点碱基突变的详

3、细信息，其中257株（7.74%）未检测到突变、3062株（92.26%）检测到rpoB基因突变。在3062株rpoB基因突变株中：531、526、516位点突变的发生率分别为54.44%（1667/3062）、27.07%（829/3062）和8.92%（273/3062）；531位点碱基突变以TCG/TTG突变为主，占93.58%（1560/1667）；526位点碱基突变主要有CAC/GAC、CAC/TAC、CAC/CGC、CAC/CTC、CAC/AAC等类型，分别占33.53%（278/829）、26.3

4、0%（218/829）、13?27%（110/829）、10.13%（84/829）、8.08%（67/829）；516位点碱基突变主要有GAC/GGC、GAC/GTC、GAC/TAC等类型，分别占35.53%（97/273）、35.53%（97/273）、16.85%（46/273）。结论中国结核杆菌利福平耐药株rpoB基因531、526、516位点碱基突变以单碱基突变为主，突变率最高的531位点碱基突变主类型较为单一，而526、516位碱基突变主类型则相对分散。【关键词】结核杆菌rpoB基因利福平耐药循证分

5、析doi:10.3969/j.issn.1671-332X.2015.07.003利福平（rifampicin，RFP）作为目前结核病短程化疗的关键药物，其主要作用机制为与结核杆菌（Mycobacteriumtuberculosis，MTB）RNA聚合酶β亚单位结合而干扰转录和RNA延伸。MTB对RFP产生耐药主要因其编码RNA聚合酶β亚单位的rpoB基因突变所致，这已是不争的事实，并由此开发了多种RFP耐药分子检测方法［1］。这些方法的研究及其逐步应用，为我们掌握MTBrpoB基因突变的分子特征及它们与耐药表

6、型之间的关系积累了丰富的资料。但是单个研究往往样本量较小，菌株代表性也不强，难能从中抽象出MTBrpoB基因突变的总体特征。遵从当今日益推崇的循证医学理念，于2013年开始我们即对PubMed数据库中MTBrpoB基因突变研究文献予以密切关注，并对中国MTB株的研究数据进行循证分析［2-3］。在分析RFP耐药MTB株rpoB基因507-533位利福平耐药决定区（rifampinresistance-determiningregion，RRDR）序列突变特征（相关数据另文发表）过程中，我们发现其531、526、5

7、16位点的基因突变各具其特点，现报道如下。1资料与方法1.1文献纳入与排除标准纳入标准：①研究对象为包括中国大陆及香港、澳门、台湾的RFP耐药MTB株；②研究菌株RFP耐药表型明确；③基因突变位点、碱基与氨基酸变化等突变信息均有良好提供。排除标准：①重复报道文献；②二次研究文献；③中、英文以外其它语种发表的文献。1.2文献检索以“rpoBANDMycobacteriumtuberculosisANDChina”、“rpoBANDMycobacteriumtuberculosisANDHongKong”、“rpo

8、BANDMycobacteriumtuberculosisANDMacon”和“rpoBANDMycobacteriumtuberculosisANDTaied数据库中检索，末期检索日期为2015年3月31日。1.3文献筛选严格按照纳入和排除标准筛选文献，2名专业人员独立阅读所获文献的题目和摘要，在排除明显不符合纳入标准的文献后，对可能符合纳入标准的文献查阅（对Pubmed数据库中非免