病原菌核酸检测技术在儿童肺炎诊断中的临床应用分析

病原菌核酸检测技术在儿童肺炎诊断中的临床应用分析

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1、病原菌核酸检测技术在儿童肺炎诊断中的临床应用分析山东省烟台毓璜顶医院摘要:A的使用呼吸道病原菌核酸检测试剂对临床痰液样本进行检测,评价该方法的检测效果和临床适应性。方法收集本科室2016年收治的儿童肺炎患者30例,各病例的痰液样本分别使用细菌培养方法和核酸检测方法进行检验,对两种检测方法的病原检出种类、数量和检测一致性进行对比。结果核酸检测结果和细菌培养检测结果有较好的一致性,对于临床上肺炎感染率最高的3种细菌,肺炎链球菌的检测总符合率为83.3%,肺炎克雷伯氏菌的总符合率为96.7%,流感嗜血杆菌的总符合率为90%。结论病原菌核酸检测技术能一

2、次检测肺炎相关的8种常见病原菌,操作简便,能快速获得检测结果,检测结果有临床价值,适用于临床的检测。关键词:社区获得性肺炎;儿童;呼吸道感染;环介导等温扩增技术(LAMP);作者简介:李爱敏,邮箱:13625352688@126.com收稿日期:2017-07-21Received:2017-07-21社区获得性肺炎(CAP)是儿童期尤其是婴幼儿常见感染性疾病。引起CAP的病原种类繁多,有细菌、病毒、支原体、衣原体、真菌、病原虫等[1][2],传统临床上对其中细菌病原的诊断一般采用培养法,但培养法耗时较长,容易贻误病情。近年来,各种分子诊断技术

3、在临床上得到了越来越广泛的应用,这些技术包括抗原抗体免疫技术、基于PCR的技术和环介导等温扩增技术(LAMP)等。环介导等温扩增技术是Notomi发明的一种核酸扩增技术,基于LAMP的检测方法具有检测时间短、灵敏度高和检测结果易于判读等优点,能辅助进行病原早期诊断。我们使用北京博奥晶典生物技术有限公司生产的呼吸道病原菌核酸检测试剂盒(恒温扩增芯片法)对本科室2016年收治的30份病例进行了检测,并与痰细菌培养检测方法进行了对比。1材料与方法1.1标本来源收集痰液样本30例,均来源于2016年收治的儿竜肺炎患者。其中2岁以下的患者18例,2岁、岁

4、的患者4例,3岁、岁的患者2例,4岁~5岁的患者5例,5岁%岁的患者1例。合格的痰液要求白细胞数大于25/低倍视野且上皮细胞〈10/低倍视野,痰液收集于样本收集管闪。1.2痰细菌学检查采用自然咳痰法留取痰标本,对留取痰液困难患者,采用吸痰法采集痰标本。将收集的合格痰液标本按《全国临床检验操作规程》第3版进行培养和鉴定。1.3痰液核酸检测使用痰液样本0.6mL,选择北京博奥品典生物技术有限公司生产的品芯®细菌棊因组DNA提取试剂盒11(玻璃珠法)作为核酸提取试剂盒进行痰液基因组核酸的提取,使用该公司的呼吸道病原菌核酸检测试剂盒(恒温扩增芯片法)、

5、RTisochipTM-A恒温扩增微流控芯片核酸分析仪和配套软件对提取的痰液核酸进行检测,使用核酸检测试剂盒能检测常见的8种呼吸道病原(肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、流感嗜血杆菌),大约1小时能得到检测结果。每个样本检测时,取20此恒温扩增试剂加入34.514.提取的核酸混合配成扩增反应液,取50HL扩增反应液加入芯片进行核酸检测。2结果2.1痰细菌学检查结果30例患者的痰样本经过培养都得到阳性培养结果,我们选择与呼吸道病原菌8项指标一致的检测项目进行分析,其中有22

6、例阳性培养结果,检出率为73.3%,结果见附表1。其中肺炎链球菌阳性例数最多,为11例,在样本中的检出率为36.7%;其次为肺炎克雷伯氏菌和流感嗜血杆菌,各占样本的13.3%;铜绿假单胞菌的比例为10%。以上结果与2006年的一项全国性调杳结果接近位1,肺炎链球菌是肺炎患者中最主要的细菌感染源,其次为肺炎克雷伯氏菌和流感嗜血杆菌,铜绿假单胞菌的检出率较高可能是因为其在儿童临床标木中较常见,当然也不能排除定植菌和环境污染的影响[4]。2.2试剂盒检测结果30例患者的痰液核酸DNA检测结果见附表2,肺炎链球菌的检出率最高,为40%,其次肺炎克雷伯氏

7、菌和流感嗜血杆菌检出率为13.3%,另检出三例铜绿假单胞菌、一例金黄色葡萄球菌。在试剂盒检出的肺炎链球菌的病例中,有9例与培养法的检测结果一致,有2例使用试剂盒检出肺炎链球菌的同吋也检出肺炎克雷伯氏菌,但细菌学检查结果为肺炎克雷伯氏菌阳性;1例试剂盒同时检出肺炎链球菌和流感嗜血杆菌的病例,细菌学检查结果为流感嗜血杆菌阳性;试剂盒检出的3例肺炎克雷伯氏蘭阳性病例的细蘭学检查结果也是肺炎克雷伯氏蘭阳性;试剂盒检出的3例流感嗜血杆菌阳性病例中,冇2例与细菌学检査结果一致。在试剂盒未检出的病例屮,2例细菌学检查结果为肺炎链球菌,1例为肺炎克雷伯氏菌,2

8、例为流感嗜血杆菌,3例力铜绿假单胞菌。试剂盒与细菌学检测结果的阳性符合率为77.3%(17/22)。2.3统计学分析附表1细菌学检查结果统计下载原表附

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