广西地区猪瘟流行毒株E2基因的序列测定与分析.pdf

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1、南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2014，45(11)：2065—2070ISSN2095一I191；CODENNNXAABhttp：／／www．．fnyxb．anDOI：10．3969，j：issn．2095-1191．2014．11．2065广西地区猪瘟流行毒株E2基因的序列测定与分析吴军1，袁小宁2，杨可妍1，欧莹1，曹佳媛1，孙翔翔1，曾咏芳1，覃雨阳1，熊毅3’(1广西大学动物科学技术学院，南宁530005；2广西大学生命科学与技术学院，南宁530005；3广西动物疫病预防控制中

2、心，南宁530001)摘要：【目的1了解广西地区流行猪瘟病毒(CSFV)E2基因的变异规律与趋势，及其与疫苗毒株基因的差异性，为制定猪瘟防控措施提供科学依据。【方法】对广西地区流行CSFV毒株的E2基因进行克隆及序列测定，并与兔化弱毒(HCLV)、石门(Shimen)毒株的E2基因进行同源性比对分析，绘制遗传进化树。【结果】广西地区流行CSFV毒株与HCLV株、Shimen株的核苷酸序列同源性为81．9％～83．3％和81．1％～82．4％，推导氨基酸序列同源性为89．3％～90．6％和87．90／一89．5％；不同广西地区

3、流行毒株间的核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性分别为90．8％～99．5％和94．1％～99．5％。且均属于S2基因群的S2．1亚群，其中广西玉林株GXYLl、GXYL2、GXYL3、GXYL4、GXYL5均属于S2．1b子群，而广西贺州株GXHZl、GXHZ2与广西北海株GXBHl、GXBH2株属于s2．1c子群。与HCLV株、Shimen株的E2基因编码氨基酸序列相比，9株广西地区流行CSFV毒株共有49处氨基酸发生变异，其中与抗原特性有关的变异有5处，分别为G713E、T724Y、E727H、1732S和$734R位点

4、。【结论】广西地区流行CSFV毒株随时间推移的变异不明显，但其遗传变异总趋势朝着偏离疫苗株的方向发展。关键词：猪瘟病毒；E2基因；序列分析；同源性；氨基酸变异中图分类号：$852．651文献标志码：A文章编号：2095—1191(2014)11-2065—06f1●l●n■1●l●l●n●3eqUenCln2andanalysisOtepldemicclassicalSWlneIeVerVlrUSstrainE2geneinGuangxiWUJunl，YUANXiao—nin92，YANGKe-yanl，OUYing1，CA

5、OJia—yuanl，SUNXiang—xiang1，ZENGYong-fang1，QINYu-yang1，XIONGYi3+(1CollegeofAnimalScienceandTechnology，GuangxiUniversity，Nanning530005，China；2CollegeofLifeScienceandTechnology，GuangxiUniversity，Nanning530005，China；3GuangxiCenterforAnimalDiseasePreventionandContml，Nan

6、ning530001，China)Abstract：【Objective】111epresentexperimentwasconductedtoinvestigatevariationlawandtrend，aswellasdi自ferencefromvaccinestrainofE2geneinclassicalswinefevervirus(CSFV)inGuangxiinordertoprovidescien—titlebasisforstipulatingpreventionandcontrulmeasuresofs

7、winefever．【Method】E2geneofpandemicCSFVindif-ferentregionsofGuangxiwerecloned，sequencedandalignedwiththatofhogcholeralapinisedvirus(HCLV)andShimenstrainstodetecttheirhomologieseachother．Thenphylogenetictreewasconstructed．【Result】GuangxicsFVstrainssharedthenucleotide

8、sequencehomologiesof81．9％一83．1％and81．3％一82．4％withHCLVandShimenstrains。respectively，andthededucedaminoacidsequencehomologiesof89．3％一90．6％and87．90％