广西狂犬病野毒株N和G基因的克隆与序列分析

《广西狂犬病野毒株N和G基因的克隆与序列分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、广西大学硕士学位论文广西狂犬病野毒株N和G基因的克隆与序列分析姓名：南松剑申请学位级别：硕士专业：预防兽医学指导教师：余克伦;罗廷荣2003.5.1彦庙大学硕士毕业论文!广西狂犬病野毒株N和G基因的克隆与序列分析摘要本试验从广西南宁、隆安和巴马分离到三株狂犬病毒野毒株，分别编号为119、GXLA和GXBM。对三株的N基因和119、GXBM株的G基因进行了RT—POR扩增、克隆和测序。将测序所得结果和收集到的国内外已发表毒株相应基因进行了核苷酸和推定氨基酸的序列进行比较分析。三株野毒之间核苷酸同源性较低，N基因分别为：89．1％(1

2、19／GXBM)。89．7％(119／GXLA)，89．4％(GXLA／GXBM)：G基因为86．7％(119／GXBM)，表明广西各地分离毒株之间存在较远的亲缘关系。比较N基因推导氨基酸序列同源性，分别为：97．8％(119／GXBM)．97．8％(119／GXLA)，99．1％(GXLA／GXBM)，表明N基因同义变异较多，其编码蛋白(NP)一级结构很稳定。将两株野毒株119、GXBM与人用疫苗3aG株和兽用疫苗ERA株的G基因进行了核苷酸序列比较，同源性介于82．7—84．O％之间，推定氨基酸同源性在88．o一91．6％之间

3、，差异非常明显。三株野毒与减毒株CTN之间的N和G基因同源性均高于与3aG、ERA株的同源性。19和GXBM株G基因推定氨基酸均有37、319两个糖基化位点，重要的抗原位点及致病性相关位点基本没有变化。，f实验结果对狂犬病的分子流行病学、致病机理的研究及基因工程疫苗开发是十分重要的。了／关键词：狂犬病病毒G基因N基因同源性一序列分析广曲{王犬蠢野毒攘靠和多基糖蝻竞玲与寿列分髓·南松铷三CLONINGANDSEQUENCESANALySISOFNGENEANDGGENEoFWILDRABIESVIRUSSTRAINSlSoLA蕈ED

4、lNGUANGXlABSTRACTInthisstudythreewildstrainsofrabiesviruswereisolatedfromNanning，LonganandBamaofGuangxiandweredesignatedas19，GXLAandGXBMrespectively．Thenucleoprotein(N)geneofthreestrainsandglycoprotein(G)geneof19、GXBMwereamplifiedbyreversetranscription—polymerasechain

5、reaction(RT—PCR)，respectively．TheRT-PCRproductswereclonedintopMD18一Tvectorandthensequenced．ThesequencesofNandGgeneandtheirdeducedaminoacidsequenceswerecomparedandanalyzedwiththatofsomeotherrabiesvirusstrainspublishedpreviouslyintheworld．ThenucleotidehomologyinNgeneamo

6、ngthreestreetstrainswere89+l％(119／GXBM)，89．7％(119／GXLA)and89．4％(GXLA／GXBM)andinGgeneamongtwostreetstrainswere86．7％(119／GXBM)．whichweredifferentandobviouslylowTheseresultssuggestedthatgeneticrelationshipinthreestrainsisolatedfromdifferentplaceofGuangxiisratherdistant。T

7、hehomologyofdeducedaminoacidsequenceofNgeneamongthethreestrainsare97．8％(119／GXBM)，97．8％(119／GXLA)and99．1％(GXLA／GXBM)respectively．彦庙大学硕士毕业论文!TheresultdemonstratedthatthereweremanysynonymousmutationsinNgeneComparisonofthesequenceofnucleotideanddeducedaminoacidofGgeneof1

8、9andGXBMwiththatof3aGandERAvaccinestrains，thehomologiesofnucleotidewererangedfrom82．7％to84．O％and88．0％to91．6％，homologiesofami