药用植物泰山四叶参dna提取方法的研究

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时间:2018-05-04

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1、药用植物泰山四叶参DNA提取方法的研究作者:史仁玖,王桂龙,宫元伟,郝岗平,王德才【摘要】  目的探讨不同DNA提取方法对泰山四叶参DNA质量的影响。方法对提取的DNA进行紫外光谱分析、总DNA电泳及RAPD分析。结果不同方法提取的DNA质量及产率存在显著差异。结论结果表明改良CTAB法和改良SDS法较好。.L.编辑。【关键词】泰山四叶参基因组DNADNA提取方法  泰山四叶参CodonopsislanceolataBenth.etHook.,属桔梗科党参属,泰山四大名药之一,以根为药,具有补血通乳、养阴润肺、益胃生津之功效[1]。本研究旨在利用RAPD分子标记技术构建不同产地四叶参D

2、NA指纹图谱,为四叶参真伪鉴定提供分子依据。高质量的基因组DNA是获取可靠分子标记结果的前提。泰山四叶参多糖、蛋白含量高,不易去除,从而影响DNA的纯度和浓度。本研究改进了传统的SDS法和CTAB法。采用改良方法所提取的DNA可作为分子生物学研究的模板,这为RAPD分子标记和后续的分子生物学研究奠定了重要基础。  1器材  MyCycler梯度PCR仪(Bio-rad公司),离心机(Sigma3K30),DNA离心真空干燥器(Savant)。  泰山四叶参叶片采自泰山药用植物园,贮存于-70℃冰箱备用。CTAB(上海生物工程技术有限公司),SDS(上海生物工程技术有限公司),PVP(上

3、海生物工程技术有限公司),β-mercap-toethanol(上海生物工程技术有限公司),Taq酶(Takara),RAPDPrimers(Opron公司)。  2方法与结果  2.1DNA提取方法及检测结果常规SDS法:参照.L.编辑。  2.2RAPD实验分析  DNA质量选择4条不同的随机引物做RAPD试验。随机引物选用美国Opron公司的OpA218(5′AGGTGACCGT3′)、OpC201(5′TTCGAGCCAG3′)、OpA167(5′CGGAGTCGAT3′)和OpC236(5′CCGGTCGCTC3′)用于扩增。RAPD的反应体系为:Taq酶0.04U/μl、d

4、NTP0.30mmol/L、Primer1.0μmol/L、Mg2+1.5mmol/L、模板1.0mg/L,10×PCR缓冲液2.5μl,ddH2O补足25μl。反应程序为94℃预变性4min,94℃变性1min,38℃复性1min,72℃延伸1min,40个循环,最后延伸1.5min。1.5%琼脂糖凝胶电泳观察、记录。  RAPD分析表明,4条引物在均可扩增出清晰的条带,有很好的多态性。两种来源DNA扩增条带清楚、结果相似,重复性较好,说明用改良CTAB法和改良SDS法所提取的DNA满足RAPD分析的需要。总体上,CTAB改良法获得的基因组DNA的扩增谱带更清晰,所获得的谱带更丰富,

5、说明此种情况下所获得的基因组DNA的质量最高(见图2)。  3讨论  高质量的基因组总DNA是进行各项分子生物学实验操作的基础。泰山四叶参叶片中含有大量的多糖、蛋白质、多酚和色素类等次生代谢物质,这给DNA的提取带来一定难度。在研究中用常规CTAB和SDS方法提取的总DNA色黄黏稠,含有大量多糖等杂质,常规SDS法提取四叶参基因组DNA的效果最差,A260/A280的比值为1.64;电泳图上有拖尾现象,说明DNA有一定程度的降解;点样孔处最亮,表明该方法去除多糖和蛋白质的效果不好。CTAB是一种阳离子去污剂,能裂解细胞、破坏细胞膜系统、使蛋白质变性,传统CTAB法提取得到的DNA沉淀粘

6、滞性很高,推测是多糖或蛋白质,因为在0.8%的琼脂糖凝胶电泳图上可以看到该方法相对应的点样孔处较亮,但相对传统SDS法,该方法去多糖的效果要好一些。改良SDS法和改良CTAB法要明显优于前两种方法,因为结合四叶参的自身性质,采用核分离液在核裂解之前将存在于细胞质中的次生物质先除去,这样就去除了大部分的次生物质。  改良CTAB法根据细胞区室化原理,即多糖和多酚类物质及其他杂质与DNA相互隔离的特性,在加CTAB裂解液之前,先用一种能维持细胞核内外渗透平衡的提取缓冲液进行抽提,这样可在细胞核裂解前将细胞间和细胞质中的多糖及酚类杂质去除,避免DNA受大量杂质的污染[6]。为了有效地去除多糖

7、和多酚类等物质的干扰,提取缓冲液中除含有维持渗透平衡的葡萄糖外,还加入了2%的可溶性PVP、2%的β-巯基乙醇和1.4mol/L的NaC1。PVP可与酚类物质结合形成水不溶性的复合物[7],β-巯基乙醇可以抑制酚类物质氧化的作用,有效地防止了提取过程中组织褐化现象的产生[8];1.4mol/L的NaC1高盐溶液增加了淀粉在乙醇中的溶解度,从而使DNA优先沉淀,有效去除了淀粉和其他多糖,降低了多糖类物质对DNA提取的影响[9]。同时改良CTAB法

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