药用植物泰山四叶参DNA提取方法的研究

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时间:2018-09-04

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1、药用植物泰山四叶参DNA提取方法的研究作者:史仁玖,王桂龙,宫元伟,郝岗平,王德才【摘要】  目的探讨不同DNA提取方法对泰山四叶参DNA质量的影响。方法对提取的DNA进行紫外光谱分析、总DNA电泳及RAPD分析。结果不同方法提取的DNA质量及产率存在显著差异。结论结果表明改良CTAB法和改良SDS法较好。编辑。【关键词】泰山四叶参基因组DNADNA提取方法泰山四叶参CodonopsislanceolataHook.,属桔梗科党参属,泰山四大名药之一,以根为药,具有补血通乳、养阴润肺、益胃生津之功效[1]。本研究旨在利用RAPD分子标记技术构建不同产地四叶参

2、DNA指纹图谱,为四叶参真伪鉴定提供分子依据。高质量的基因组DNA是获取可靠分子标记结果的前提。泰山四叶参多糖、蛋白含量高,不易去除,从而影响DNA的纯度和浓度。本研究改进了传统的SDS法和CTAB法。采用改良方法所提取的DNA可作为分子生物学研究的模板,这为RAPD分子标记和后续的分子生物学研究奠定了重要基础。1器材MyCycler梯度PCR仪(Bio-rad公司),离心机(SigmaK30),DNA离心真空干燥器(Savant)。  泰山四叶参叶片采自泰山药用植物园,贮存于-70℃冰箱备用。CTAB(上海生物工程技术有限公司),SDS(上海生物工程技术有

3、限公司),PVP(上海生物工程技术有限公司),β-mercap-toethanol(上海生物工程技术有限公司),Taq酶(Takara),RAPDPrimers(Opron公司)。方法与结果.1DNA提取方法及检测结果常规SDS法:参照文献[2]操作;常规CTAB法:参照文献[3]操作。  改良CTAB法,参考文献[4]并改进:称取泰山四叶参叶片,液氮研磨成细粉状,加入600μl核分离液[100mmol/LTris-HCl(),0mmol/LEDTA(),00mmol/LNaCl,2%PVP(W/V),2%β-巯基乙醇(V/V)],迅速研磨成匀浆状,转入的离

4、心管,℃,000r/min离心10min。弃上清,加入600μl预热的CTAB核裂解液[100mmol/LTris-HCl(),50mmol/LEDTA(),/LNaCl,2%CTAB(W/V),2%PVP(W/V)],6℃水浴保温60min。冷却几分钟后加入600μl氯仿/异戊醇,摇匀室温放置min,10000r/min离心10min,重复抽提1次。取上清,加入1/5体积的mol/L的NaCl,加入2/体积的预冷异丙醇摇匀,室温放置1min后可见白色丝状DNA沉淀析出。室温离心去上清后加入70%的乙醇清洗次,真空干燥后加入200μlTE溶解沉淀,加入RNa

5、seA至终浓度为10μg/ml,3℃水浴保温30min。加入等体积的氯仿/异戊醇,混匀,10000r/min,室温离心10min,取上清加入1/10体积的mol/LNaAc,混匀后再加入倍体积的无水乙醇,-20℃放置30min。离心,弃上清,70%的乙醇清洗2次,室温风干后溶于50μl的TE中,-20℃贮存备用。  改良SDS法,参考文献[5]并改进:称取四叶参幼叶于预冷研钵中,液氮研磨成细粉状后立即加入600μl核分离液,迅速研磨成匀浆状,小心转入的离心管。℃,000r/min离心10min;弃上清,加入600μl预热的SDS核裂解液,同时洗净管盖及管壁上

6、残留的植物组织,用灭菌牙签轻轻混匀,6℃水浴保温60min,期间不时轻轻摇动离心管几次;冷却几分钟后加入600μl氯仿/异戊醇摇匀室温放置min,10000r/min,离心10min。转移上清,重复抽提1次;取上清,加入1/体积的mol/L的NaCl,混匀,加入2/体积的预冷异丙醇摇匀。℃放置30min,此时可见白色絮状DNA沉淀析出于离心管液相中上部,而细胞碎片及其它杂质沉淀于离心管底部;用灭菌牙签将DNA沉淀挑出,用70%的乙醇漂洗2次,真空干燥后加入200μlTE溶解沉淀,加入RNaseA至终浓度为10μg/ml,3℃水浴保温30min;加入等体积的氯

7、仿/异戊醇,混匀,10000r/min,室温离心10min,取上清加入1/10体积的mol/LNaAc,混匀后再加入2倍体积的无水乙醇,-20℃放置30min;离心,弃上清,沉淀用再70%的冷乙醇清洗2次,真空干燥后溶于50μl的TE中,-20℃贮存备用。  用%琼脂糖电泳和紫外分光光度计测定A260/A280的方法判定DNA的质量。  种方法提取泰山四叶参叶片DNA,结果表明常规SDS法和常规CTAB法提取的基因组DNA样品中蛋白质含量较高,A260/A280比值均小于,样品的浓度较高;改良SDS法和改良CTAB法提取的基因组DNA样品浓度较低,分离的基因

8、组DNA样品中蛋白质含量较低,A260/A280比值

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