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1、研究论文中国蔬菜CHINAVEGETABLES2015(8):22-27番茄品种SSR标记鉴定技术研究*赵海艳 吴明生 宋 歌 牛 茜 田慧芳(北京市种子管理站,北京100088)摘 要:以16个番茄品种为材料,从200对番茄SSR引物中筛选出20对适合用于番茄品种鉴定的引物,用该20对引物对66个番茄品种进行分析,共检测出52个等位基因变异,等位基因变异范围为2~5个,平均每个位点产生2.6个等位基因变异。通过遗传聚类方法对引物组合的品种鉴别能力进行分析,结果显示仅用9对引物构成的引物组合就可以对66个番茄品种进行有效鉴别,该9对引物组合构建的SSR-DN
2、A指纹图谱可作为品种的遗传标签用于品种真伪鉴定。关键词:番茄;SSR;品种鉴定;指纹图谱番茄(SolanumlycopersicumL.)是我国的主要番茄品种的SSR-DNA指纹,以期为番茄品种分子栽培蔬菜之一,但我国番茄种质资源相对匮乏,加鉴定和品种权保护提供技术支撑。上消费者对番茄风味的特殊要求,导致育种单位所1 材料与方法采用的育种材料集中在少数种质资源上,育成的品种遗传差异小。由于亲缘关系相近的品种很难利用1.1 试验材料外观形态加以区别,容易出现一品多名、一名多品,试验于2013~2014年在北京市种子管理站种或以劣充好的违法行为。因此,亟须建立一套
3、准确、子检测室进行。供试番茄材料由本站收集,共计高效的番茄品种鉴定技术。66个品种,包括樱桃番茄和普通番茄,其品种名与传统的品种鉴定方法相比,SSR分子标记称和主要性状见表1。具有多态性高、重复性和稳定性好等优点,广泛用1.2 试验方法于玉米、水稻等主要农作物的品种鉴定和指纹图谱1.2.1 DNA提取 采用新型植物基因组DNA提构建(宋建等,2006),在品种打假维权方面取得取试剂盒(TIANGEN,北京)提取番茄的基因组很好效果。在番茄方面,Suliman等(2002)利用DNA,于-20℃保存备用。AFLP、SSR、SNP等技术对番茄品种进行多态性分1.
4、2.2 SSR引物 200对SSR引物来自Benor等析,认为SSR标记较适合于种质资源多样性分析。(2008)和番茄基因数据库(http://www.sgn.cornell.王日升等(2006)比较了SSR标记和形态标记在番edu),普通引物由北京鼎国昌盛生物技术有限责任茄栽培品种遗传多样性的分析结果上具有高度一致公司合成,荧光标记引物由上海英骏生物技术有限性,表明SSR标记可用于番茄品种鉴别。本试验对公司合成。200对番茄SSR引物进行筛选获得适合番茄品种鉴1.2.3 PCR扩增 PCR反应体系总体积为12μL。-1定的候选引物,通过遗传相似聚类分析方法
5、确定适包括30ng模板DNA,MgCl22.5mol·L,dNTPs0.15-1-1合66个番茄品种鉴定的SSR引物组合,并构建了mol·L,引物0.25μmol·L,Taq聚合酶0.1U,1×TaqBuffer。赵海艳,女,硕士,农艺师,专业方向:种子质量检测,E-mail:PCR反应程序:94℃预变性5min;94℃变性zhaoh_yan@163.com40s,58℃退火35s,72℃延伸45s,共36个循环;*通讯作者(Correspondingauthor):吴明生,男,高级农艺师,专业方向:72℃延伸10min,
6、扩增产物4℃保存。种子质量检测,E-mail:chpwcx2010@sina.com1.2.4 PCR产物检测 普通引物的PCR产物和荧收稿日期:2014-06-06;接受日期:2014-11-15基金项目:北京市科技计划项目(D131100000413001)光标记引物的PCR产物分别通过生物大分子分析—22—《中国蔬菜》学术论文下载www.cnveg.org中国蔬菜CHINAVEGETABLES研究论文表166个番茄品种的名称及主要性状序号品种名称植株及果实性状序号品种名称植株及果实性状1贝蒂无限,卵圆形,小果,红色34芙蓉无限,圆形,大果,红色有
7、果尖2佳西娜无限,圆形,中小果,红色35青研1号有限,圆形,中果,红色3贝美无限,卵圆形,小果,红色36迪利奥无限,圆形,中果,红色4红玉无限,椭圆形,小果,红色37维纳斯无限,圆形,小果,橙黄色5小皇帝半有限,椭圆形,小果,橙黄色38白果强丰无限,圆形,中果,红色6樱莎红4号无限,卵圆形,小果,红色39锦绣无限,扁圆形,中果,红色7喀秋莎无限,圆形,中小果,红色40佩坦赞无限,扁圆形,中果,红色8维莎半有限,椭圆形,小果,粉红色41红太阳有限,圆形,大果,红色,9布兰妮无限,圆形,大果,红色42格蕾斯无限,卵圆形,小果,红色10北京樱桃番茄无限,圆球形,小果,
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