棉花品种遗传纯度的ssr分子标记鉴定技术研究

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1、棉花学报CottonScience2013袁25渊5冤院382~387棉花品种遗传纯度的SSR分子标记鉴定技术研究11121*刘国栋袁王芙蓉袁宫永超袁马和欢袁张军(1.农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室／山东棉花研究中心袁济南250100曰2.山东师范大学生命科学学院袁济南250014)摘要院为建立适合于SSR标记的棉花品种纯度鉴定方法袁利用78个SSR标记对12个棉花常规品种进行标记基因型分析遥通过比较不同品种不同单株标记基因型袁发现棉花品种的非纯SSR位点存在3种主要类型遥通过综合分析非纯SSR位点率和异型单株率对品种遗传

2、纯度的影响袁建立了利用SSR标记在分子水平上鉴定棉花品种纯度的方法遥利用该方法鉴定的12个棉花品种中有3个品种渊C5尧C9和C11冤的遗传纯度在98%以上袁非纯SSR位点和异型株均较高的2个品种渊C3和C6冤遗传纯度分别为67.31%和31.79%袁该方法弥补了以往分子纯度计算方法中只考虑单株混杂尧不考虑SSR位点混杂的缺陷袁可比较客观地反映品种的遗传纯度状况遥关键词院棉花品种曰SSR曰非纯位点曰遗传纯度中图分类号院S562.035文献标志码院A文章编号院1002-7807渊2013冤05-0382-0611121*LIUGuo-don

3、g,WANGFu-rong,GONGYong-chao,MAHe-huan,ZHANGJun(1.250100,;2.250014袁)Toestablishamethodforgeneticpurityidentificationofcotton(L.)varietiesbySSRmarkers,markergenotypesof12conventionalcottongenotypevarietiesweresurveyedusing78pairsofcoreSSRprimers.BycomparingSSRlocifromdiffe

4、rentindividualsofalltestedcottonvarieties,thenon-homozygousSSRallelesofcottonvarietyweredividedintothreetypicalscenariosatthemolecularlevel.Consequently,amethodforthegeneticpurityidentificationofcottonvarietiesusingSSRmarkerswasproposedbaseduponanalysisofthecomprehensive

5、influencesofbothnon-homozygousSSRlociandtherateofheterotypeindividualsinthecottonvarieties.Forthegeneticpurityof12cottonvarietiestestedbythismethod,threevarieties(C5,C9andC11)wereabove98%,whiletwovarieties(C3andC6)were67.31%and31.79%,respectively.Themethodproposedtakesin

6、toaccountboththeinfluencesoffarraginousindividualsdetectedbySSRmarkersandtheinheritednon-homozygousSSRlocionthepurityofacottonvarieties,andtherefore,providesaneffectiveandreliablewaytoidentifytheuniformityandstabilityofcottonvarieties.cotton(L.)variety;SSR;non-homozygous

7、loci;geneticpurity品种纯度反映品种的一致性和稳定性袁是品实际需要袁迫切需要开发新的尧可靠的品种纯度种鉴定的一项重要指标遥目前棉花品种的纯度鉴检测方法遥DNA分子标记技术因其分辨率高尧重定以田间种植的表型鉴定为主遥表型纯度鉴定周复性好和简单快速等优点适应了这一需求遥在期长袁易受环境因素影响袁而且表型特征的判定DNA分子标记技术中袁SSR(Simplesequence标准不易把握遥近年来袁虽然转Bt基因抗虫棉品repeats)分子标记因其共显性遗传且多态性丰富种数目日益增多袁陆地棉品种间的遗传基础却成为目前品种分子鉴定实验

8、中应用最广泛的一种[1-2][3-5]越来越窄袁传统的表型鉴定方法已经不能满足分子标记遥在品种纯度鉴定方面袁SSR标记主要收稿日期院2012-11-28作者简介院刘国栋渊1981-冤袁男袁硕士袁助理研究员,