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1、棉花学报CottonScience2014袁26渊6冤院483~491利用SSR分子标记进行棉花品种鉴定的研究1,23*222313*张小娟袁陆徐忠袁何团结袁路曦结袁郑曙峰袁倪金龙袁张冰清袁杨剑波渊1.安徽农业大学袁合肥230031曰2.安徽省农科院棉花研究所袁安庆246003曰3.安徽省农科院水稻研究所袁合肥230031冤摘要院利用均匀分布于棉花26条染色体上的39对SSR核心引物对16个不同来源的棉花品种样品进行区别与鉴定实验袁探讨了棉花品种鉴定的取样方案和位点异同判读方法遥通过比较不同取样量样品包含的遗传信息袁确定了基本的取样量袁并将样品间位点异同类型分为相同位点尧疑似相同位点
2、和差异位点遥据此对16个品种进行位点异同性分析袁结果表明同一品种的不同样品间差异位点数均在0～2间袁而不同品种间的差异位点数介于5～25遥结合品种间差异位点的阈值分析袁研究认为当两样品间差异位点数＞2时袁即判定为不同品种曰当差异位点数臆2时袁即判定为近似或极近似品种遥关键词院棉花曰品种鉴定曰SSR分析曰带型差异中图分类号院S562.02文献标志码院A文章编号院1002-7807渊2014)06-0483-091,23*22231ZhangXiaojuan,LuXuzhong,HeTuanjie,LuXijie,ZhengShufeng,NiJinlong,ZhangBingqing,
3、3*YangJianbo(1.230031,;2.,246003,;3.230031,)Toassessthesamplingmodeandsitedeterminationmethodsforidentifyingcottonvarieties,39pairsofSSRprimersdistributedevenlyonthe26chromosomesofcottonwerescreenedin16cottonvarieties,andshowedhighpolymorphismandgoodrepeatability.Thebasicsamplingamountwasdeterm
4、inedbycomparingthegeneticinformationofdifferentsamplingmodes.Thesiteswereclassifiedintothreetypes:thesamelocus,thesuspectedsamelocus,andthediscrepantlocus,accordingtothesimilaritiesanddifferencesofsites.Thesimilaritiesanddifferencesofsitesinthe16varietieswereanalyzedusingtheabovescheme.Theresul
5、tsshowedthatthenumberofdiscrepantlociforthesamevarietywasbetween0and2,andthenumberfordifferentvarietiesrangedfrom5to25.Basedontheanalysisofthediscrepantlocusthresholdbetweendifferentvarieties,samplescanbedeterminedtobedifferentwhenthenumberofdiscrepantlociismorethan2,andsimilarwhentherearefewer
6、than2discrepantloci.cotton;varietyidentification;SSRanalysis;discrepantpatterns学报页脚[6]棉花是关系国计民生的重要经济作物袁优良定的需求袁因此袁生产和市场迫切需要一种科学[1-2]品种是保证其优质尧高产特性的关键遥目前生有效的品种鉴定方法遥产上应用的品种类型主要有常规棉尧杂交棉尧转DNA分子标记技术的发展袁促进了品种鉴定[3]基因抗虫棉等遥近年来袁种子市场的快速发展袁技术的进步遥RAPD渊Randomamplifiedpolymor-促进了育种主体和经营主体的多元化袁品种野套phicDNA冤尧AFLP渊
7、Amplifiedfragmentlength[4]牌冶尧野冒牌冶的现象也随之出现袁品种权纠纷也polymorphism冤尧SSR渊Simplesequencerepeats冤等[5][7]日渐增多袁仅依靠形态学鉴定难以满足品种鉴分子标记相继被用于品种鉴定袁其中SSR标记收稿日期院2014-03-17作者简介院张小娟(1986-),女,硕士研究生,zhangxiaojuanah@163.com曰*通讯作者,yjian-bo@263.net;luxuzhon
