麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析.pdf

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1、山东农业科学2013，45(11)：7～i1ShandongAgriculturalSciences麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析张建朋，张士刚，陈新，徐丽，贾建云。，张力思。，刘庆忠(1．龙口市农业技术推广中心，山东龙口265701；2．泰安市农业局，山东泰安271000；3．山东省果树研究所／山东省果树生物技术育种重点实验室，山东泰安271000)摘要：CBF基因是植物CBF抗冷途径的枢纽，对增强植物抗冷能力极为重要。本研究根据已知的核桃CBF基因序列设计通用性引物，对麻核桃cDNA进行PCR扩增，成功

2、获得麻核桃CBF基因全长序列，命名为JhCBF。JhCBF全长820bp，包含一个645bp的开放读码框(ORF)，编码214个氨基酸。序列分析表明JhCBF与其他物种来源的CBF具有较高的同源性，其中，与桦木科白桦的同源性最高，为61．22％；JhCBF含有一个预测的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。系统进化树分析表明JhCBF与桦木科白桦的亲缘关系最近，最先聚为一类。关键词：麻核桃；CBF基因；克隆；生物信息学分析中图分类号：Q785文献标识号：A文章编号：1001—4942(2013)11—0007—0

3、5CloningandBioinformaticAnalysisofCBFGenefromJuglanshopeiensisHuZhangJianpeng，ZhangShigang，ChenXin，XuLi，JiaJianyun，ZhangLisi，LiuQingzhong(1．LongkouAgriculturalTechnologyPromotionCenter，Longkou265701，China；2．TaianAgriculturalBumau，Taian271000，China；3．ShandongIn

4、stituteofPomology／ShandongPr~inciaKeyLaboratoryofFruitTreeBiotechnologyBreeding，Taian271000，China)AbstractCBFgeneplaysacentralroleinCBFcold—responsepathwayinplant．Itisveryimportantinincreasingplantcoldtolerance．Universalprimersweredesignedaccordingtopublishedw

5、alnutCBFgenes，andthenPCRamplificationwascarriedoutusingJuglanshopeiensiscDNA．Finally，theJuglanshopeiensisCBFgenewasobtained，namedJhCBF．Thefull—lengthofJhCBFwas820bp，containinganopeningread-ingframe(ORF)of645bp．Thededucedproteinhad214aminoacids．Sequenceanalysis

6、showedthatJh—CBFsharedhighhomologywithCBFfromotherplants．Amongthem，thehomologywithCBFfromBetulaplatyphylla(Betulaceae)wasthehighestof61．22％．JhCBFcontainedapredictedAP2domainandtwopep-tidesequenceswhichwerespecifictoCBF．PhylogenetictreeanalysisindicatedthatJhCB

7、Fhadtheclosestre-lationshipwithCBFfromBetulaplatyphylla(Betulaceae)，andtheywereclusteredintoonegroupfirstly．KeywordsJuglanshopeiensisHu；CBFgene；Clone；Bioinformaticanalysis麻核桃(JuglanshopeiensisHu)属胡桃科核桃中属于最高档次的品种。低温冻害是影响核(Juglandaceae)胡桃属(Juglans)，主要分布在河桃生长发育、造

8、成核桃产量和质量下降的主要因北、天津、山西和北京的部分山区。麻核桃集纹路素之一。南方的泡核桃引种到北方种植时，多数多变、皮质良好、造型优美等优点于一身，在文玩因低温胁迫致死，而我国独有的麻核桃能够在河收稿日期：2013—07—29基金项目：科技部科技基础工作资助项目“国家核桃板栗种质资源平台”(2013—048)；农业部种质资源保护项目(2013—26)；山