海岛棉5个CBF-DREB基因的克隆与表达分析

海岛棉5个CBF-DREB基因的克隆与表达分析

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1、棉花学报CottonScience2016袁28渊1冤院42―51海岛棉5个基因的克隆与表达分析*李月袁代培红袁刘超袁苏秀娟袁孔丽颖袁李翔袁李才运袁刘晓东渊新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室袁新疆乌鲁木齐830052冤摘要院低温尧干旱和盐渍是影响作物生长尧产量和全球地理分布的重要非生物胁迫遥CBF/DREB转录因子是参与植物非生物胁迫应答反应的重要调控蛋白遥为了更好地了解棉花家族基因袁通过生物信息学的方法袁从海岛棉中克隆了5个具有完整开放阅读框的基因袁命名为5遥这5个基因编码的蛋白与其他植物冷胁迫相

2、关的CBF蛋白具有高度的保守性袁含有1个AP2功能结构域和2个特征基序遥系统进化树分析表明袁这5个基因与拟南芥的3个参与冷胁迫的基因一起聚类在DREB亚家族中的A-1亚组遥通过RT-PCR的方法分析了海岛棉基因1―5在高盐渊200mmol窑L-1NaCl冤尧干旱尧4℃低温等非生物胁迫处理下的表达模式遥结果表明其中2个基因在冷胁迫下上调表达袁5个基因在干旱和盐处理下均下调表达遥这些为进一步探索基因在棉花逆境胁迫应激反应中的作用提供了有价值的信息遥关键词院棉花曰海岛棉曰CBF/DREB转录因子曰基因克隆曰基因表

3、达调控曰冷胁迫中图分类号院S562.035.3文献标志码院A文章编号院1002-7807(2016)01-0042-1010.11963/issn.1002-7807.201601006*LiYue,DaiPeihong,LiuChao,SuXiujuan,KongLiying,LiXiang,LiCaiyun,LiuXiaodong(830052,)Lowtemperature,drought,andsalinityaremajorabioticstressesthatinfluencethesurviv

4、al,productivity,andgeo-graphicaldistributionofmanyimportantcropsworldwide.TheC-repeat/dehydration-responsiveelementbindingtranscriptionfactors(CBF/DREB)areimportantproteinsinvolvedintheresponsetoplantabioticstresses.Tobetterunderstandgenes,weidentifiedfive

5、fromislandcotton(L.)usingabioinformaticsapproach.Thesegenes(1-5)wereshowntoencodeproteinsthatshareahighsimilaritywithplantcoldstress-relatedCBFproteins,whichcontaintheclassicAP2domainandtwoCBFsignaturesequences.Phylogeneticanalysisrevealedthattheisolatedco

6、ttongenescouldbeclassifiedintotheA-1subgroupoftheDREBsubfamilywith1-3genesin.Semi-quantitativereversetranscriptionPCRwasusedfortheexpressionprofilingofthefivegenesunderdifferentabioticstresses(200mmol窑L-1NaCl,drought,and4℃).Twoofthegeneswereshowntobeup-reg

7、ulatedincottonplantsundercoldstress,whileallthefivegenesweredown-regulatedundersalinityanddroughttreatments.Ourfindingsprovidevaluableinformationforfurtherexploringtherolesofthegenesincottondevelopmentandintheresponsetostress.cotton;L.;CBF/DREBprotein;gene

8、cloning;regulationofgeneexpression;coldstress高盐尧低温和干旱等非生物胁迫是影响植物导或抑制目的基因表达袁使植物在生理生化方面生长和发育的重要限制因子遥近年关于植物对这做出适应性调整袁最终通过代谢调控袁阻止细胞[1]些非生物逆境的抗性机制研究表明袁转录因子在发生损伤袁增强植物的抗逆性遥CBF/DREB渊C-re-逆境信号传导中起重要作用遥转录因子通过peatbindin

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