基因表达谱芯片筛选寻常型银屑病相关基因的研究.pdf

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1、皮肤病与性病2013年l2月第35卷第6期JDermatologyandVenereologv，Dec2013．Vo1．35．No．6·论著·313基因表达谱芯片筛选寻常型银屑病相关基因的研究周珉菲，徐丽敏※(1．深圳市龙岗坪地人民医院皮肤性病科518117；2．天津长征医院，天津300120)【摘要】目的运用基因芯片技术研究寻常型银屑病的基因表达谱，筛选寻常型银屑病相关基因。方法从4例寻常型银屑病患者及1例正常人的外周血中提取并分离得到总RNA。将总RNA纯化，并逆转录合成单链、双链cDNA。纯化双链cDN

2、A后，体外转录合成生物素标记的cRNA，并与寡核苷酸芯片进行杂交使用激光共聚焦扫描仪进行图像扫描。配合数据处理软件读取、处理数据，筛选出2倍及以上差异表达基因。结果筛选出的2倍及以上差异表达基因占每张芯片上基因总数的1．270％～4．644％，这些基因主要分属于免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、代谢相关基因、蛋白质翻译和合成相关基因、DNA结合、转录和转录因子类基因、发育相关基因等。4例寻常型银屑病患者与正常人相比较有共同差异表达的基因共52个，其中17个基因表达上调，35个基因表达下调。结论基因芯片

3、技术有较高的重复性和稳定性，能有效地进行寻常型银屑病相关基因的初步筛选【关键词】寻常型银屑病；基因表达谱；基因芯片；差异表达中图分类号：R446；R758．63文献标志码：Adoi：10．3969／j．issn．1002—1310．2013．06．002ScreenthegenesassociatedwithpsoriasisvulgariswithgeneexpressionprofilesZHOUMin币，XULi—min(1．DepartmentofDermatology，LongGangPingDiP

4、eopleSHospitalinShenZhen，ShenZhen430079，China；2．TiaajinChangzhengHospital，死Ⅱnjin300120，China)【Abstract】ObjectiveToinvestigatethegeneexpressionprofilingofpsoriasisvulgariswithGenechiptechnology，andtoscreentheassociatedgenesofpsoriasisvulgaris．MethodsThetotal

5、RNAwasextractedfromtheperipherybloodsamplesof4psoriasisvulgarispa—tientsand1normalcontro1．ThetotalRNAwaspurifiedandreverselytranscriptedtosingle-strandedanddouble—strandedcDNA．ThebiotinlabeledcRNAwasproducedbytranscriptionandhybridizatedwitholigonucleotidem

6、icroarrayinvitro．Imagescanningwasper—formedusingaconfocallaserscanner．Screeningout2timesandabovedifferentiallyexpressedgeneswithDataprocessingsoftware．Re—suhsThenumbersof2timesandabovedifferentiallyexpressedgenewereaccountedforthetotalnumberofgenes1．270％～4．

7、644％ineachchip．Thesegenesmainlyrelatedtotheimmunity，thecellsignal，thetransmissionprotein，themetabolism，theproteintransla—tionandsynthesis，theDNAcombinationandtranscriptionandtranscriptionfactor，thegrowth，andSOon．Comparedwiththecontrol，52genesthatcommondiffe

8、rentiallyexpressedwerepickedupfrom4samplesofpsoriasisvulgaris．Among52genes，17geneswereup—regulatedand35genesweredown—regulated．ConclusionThegenechiptechnologyhasthehighduplicationandthestability．Itcane