基因表达谱芯片技术筛选乙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白.pdf

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1、第28卷第2期西安交通大学学报(医学版)Vol.28No.22007年4月JournalofXi，anjiaotongUniversity(Medicalsciences)APr.2007基因表达谱芯片技术筛选乙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白基因Cl反式调节基因蔺淑梅‘，成军“，杨媛‘，刘敏‘，张黎颖“，郭江“(l.西安交通大学医学院第一附属医院传染科，陕西西安710o61;2.北京地坛医院传染病研究所，北京100011)摘要:日的对未知功能基因Cl转染人肝母细胞瘤细胞系(HePG2)后的基因表达谱进行分析，探索该基因的表达对肝细胞基因表达谱的

2、影响及其可能的调节功能线索。方法以分子生物学技术构建CI的真核表达载体PcDNA3.1(一)一Cl，以表达质粒peDNA3.1(一)一Cl转染HePGZ细胞，空载体peDNA3.卜)为平行对照，制备转染后的细胞裂解液，提取mRNA，逆转录为cDNA。应用基因表达谱芯片技术对差异表达的mRNA进行检测和分析。结果H叩GZ细胞经转染Cl表达质粒后，有26条差异表达基因，其中24条基因表达水平下调，2条基因表达水平上调。这些差异表达的基因与细胞信号转导、凋亡、细胞增生分化及肿瘤的发生密切相关。结击应用基因表达谱芯片成功筛选了Cl转染细胞后差异表达

3、基因，为进一步阐明Cl蛋白可能的生物学功能及乙型肝炎病毒核心蛋白的致病机制提供了理论依据。关键词:乙型肝炎病毒;核心蛋白;反式激活基因;基因表达谱芯片中图分类号:R392.11文献标识码:A文章编号:1671一8259(2007)02一0126一04ScreeningandidentiflcationofgenestransactivatedbyC1ProteinbymlCroarrayaSSayLinshumei‘，ChengjunZ，Yangyuan‘，LiuMin‘，ZhangLiyingZ，GuojiangZ(1·Departmen

4、toflnfectiousDiseases，TheFirstAffiliatedHOspital，MedicalschoolofXi’anjiaotongUniversity，Xi’an710061;2.InstituteoflnfectiousDiseases，BeijingDit县户Hospital，Beijingl00011，China)ABSTRACT:ObiectiveToclarifytheeffectoftheexpressionofthenewgeneC1onspectraofthehepatocytegeneexPress

5、ion，andcomParethedifferentiaIlyexPressedgenesbetweentheHePG2e11stransfectedwithpcDNA3.1(一卜clandcontrolvector[pcDNA3.1(一)〕，respectively，bycDNAmicroarraytechnique.MethodsHepG2cellsweretransfectedbyrecombinedexpressionp1asmidpcDNA3，1(一卜ClandpcDNA3.1(一)，resPectively.TotalRNAwa

6、sisolatedfromthetransfectedHePG2cellswithPcDNA3.1(一)andPcDNA3.1(一卜Cl，resPectively.cDNAwasPreParedbyreversetranscriPtion.cDNAmicroarraytechniqueWasusedtodetectthedifferentiallyexpressedgenesbetweenthetwogroups.ResultsAfterscreeningwithDNAmicroarray，wefoundthat24genesweredow

7、n一regulatedwhileZgeneswereuP一regulated，amongwhichsomegenescodingproteinswereinvolVedincellsignaltransduction，cellaPOPtosis，cellProliferationanddifferentiation，andtumorformation.ConCIusiOncDNAmicroarraytechnologyisusedtosuccessfullyscreenthegenesdifferentiallyexpressedinC1-

8、exPressingHePGZcells，whichbringssomenewcluesforstudyingthebiologicalfunctionsofClandinfec