莲草直胸跳甲Hsp70蛋白的生物信息学分析.pdf

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1、山西农业科学2015，43(4)：397-400JoILI-I~ofShanxiAgriculturalSciencesdoi：10．3969~．issn．1002—2481．2015．04．08莲草直胸跳甲Hsp70蛋白的生物信息学分析贾栋，赵龙龙，王森，付淑慧，郭艳琼，马瑞燕(1．山西农业大学农学院，山西太谷030801；2．山西农业大学生命科学院，山西太谷030801)摘要：根据莲草直胸跳甲Hsp70基因的EST序列，利用电子克隆的方法获得莲草直胸跳甲Hsp70基因，通过生物信息学方法对该基因编码蛋白进行了保守结构域、疏水，亲水性、亚细胞定位、信号

2、肽等理化性质和分子特性分析。结果表明，莲草直胸跳甲Hsp70基因全长2216bp，完整读码框1899bp，编码632个氨基酸残基，分子量为69．45kDa，等电点为6．00；编码蛋白含有Hsp70的完整保守结构域和典型签名序列；具有的典型细胞质基序和亚细胞定位分别表明Hsp70位于细胞质中。研究结果可为深入研究该基因的生物学功能奠定基础。关键词：莲草直胸跳甲；Hsp70；电子克隆；生物信息学分析中图分类号：$451文献标识码：A文章编号：1002—2481(2015)04—0397—04BioinformaticAnalysisofAgasideshyg

3、rophilaHsp70JIADong，ZHAOLong—long’，WANGSen，FUShu—hui，GUOYan-qiong，MARui-yan(1．CollegeofAgronomy，ShanxiAgriculturalUniversity，Taigu030801，China；2．CollegeofLifeSciences，ShanxiAgriculturalUniversity，Taigu030801，China)Abstract：Hsp70wasclonedbasedonitsESTsequencesfromAgasicleshygrophi

4、la．PhysicochemicalpropertiesandmolecularfeaturesofHsp70werepredictedbybioinformaticsapproachesincludingconserveddomain，hydrophobicorhydrophilic，subcellularlo—calization，signalpeptide．Theresultsshowedthattheful-lengthHsp70was2216bp，anditcontainedacompleteORFwhichencoded632aminoaci

5、ds，andamolecularweightof69．45kDa，isoelectricpointof6．00；Hsp70containedcompleteconserveddomainandtypicalsequence；itstypicalcytoplasmicmotifandsubeellularlocalizationhadindicatedthatHsp70locatedinthecytoplasm．Theresultswillprovidebasisforthein—depthstudyofbiologicalfunctionofHsp70．

6、Keywords：Agasicleshygrophila；Hsp70；insilicocloning；bioinformaticanalysis热激蛋白(heatshockproteins，Hsps)是生物体起源于南美洲的入侵性植物171，目前已扩散至北美、暴露于各种胁迫因子比如极端温度、气体、细胞能亚洲、澳大利亚及一些相邻的岛国I81。20世纪30年量损耗、焦虑和各种有毒物质时所合成的一小类蛋代，喜旱莲子草被作为饲料作物引入我国，由于它白。这类蛋白充当分子伴侣具有较多的细胞调节功能适应不同生境、迅速蔓延且难以控制，对人侵地能，比如折叠、装配、胞内定位、

7、分泌和降解等，即使的生物多样性、生态系统和社会经济均造成严重威在未受影响和胁迫的细胞中也发挥类似的功能【。胁，因而，其成为全球l生的恶性杂草。而莲草直胸跳根据分子量的大小，热激蛋白被划分和命名为不同甲(Agasicleshygrophila)是一种原产于南美洲阿根的家族：Hsp90，Hsp70，Hsp60，Hsp40以及小分子廷的喜旱莲子草的专食性天敌昆虫l101。其温适性较Hsps(smallHsps)，每一个家族通常又由一至多个差，夏季高温季节是喜旱莲子草的生长高峰期，但相关成员组成[41。在Hsp家族中，Hsp70是含量丰富、高温却对莲草直胸跳甲的

8、种群具有明显的抑制作序列保守、功能重要的一种细胞保护蛋白，也是近用Ill】。研究