EvaGreen实时荧光定量PCR检测猪圆环病毒2型方法的建立-论文.pdf

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1、生物技术通报·技术与方法·BIoTECHNoLoGYBULLETIN2O14年第6期EvaGreen实时荧光定量PCR检测猪圆环病毒2型方法的建立蔡晔饶品彬吴海港姜永厚(浙江理工大学生命科学学院,杭州310018)摘要:根据GenBank中的猪圆环病毒2型(PCV2)0RF4基因序列设计一对特异性引物,通过常规PCR扩增PCV2的ORF4基因,并将其纯化的PCR产物克隆入pMD18.T载体中,构建重组质粒。应用该重组质粒进行EvaGreen实时荧光定量PCR,建立了PCV2DNA的标准曲线,并进行熔解曲线分析。结果显示:建立的EvaGreen实时荧光定量

2、PCR特异性强,与其他非靶标病毒基因不发生交叉反应;灵敏度高,最高可检测到10拷贝/的病毒量;重复性好,3个浓度的批间和批内的变异系数均小于2.5%;对ll8份临床样品进行检测,阳性样品25份,阳性率为21.2%,检测结果与普通PCR相符率为99.2%,其中一份样品经荧光PCR检测为PCV2阳性,普通PCR检测为阴性。结果表明,建立的EvaGreen实时荧光定量PCR方法具有特异性强、敏感度高、重复性好、简便快捷等特点,可用于临床PCV2感染的早期诊断以及分子流行病学调查。关键词:猪圆环病毒2型EvaGreen实时荧光定量PCR检测Development

3、ofEvaGreenReal—timeFluorescenceQuantitativePolymeraseChainReactiontoDetectPorcineCircovirusType2CaiYeRaoPinbinWuHaigangJiangYonghou(CollegeofLifeScience,ZhejiangSci-TechUniversity,Hangzhou310018)Abstract:AccordingtogenomesequencesofORF4ofporcineeircovirustype2(PCV2)publishedinGen

4、Bank,apairofprimerswasdesigned.TheORF4genewasamplifiedwithtraditionalPCR.ThePCRproductwasclonedintopMD18-Tvectorandsequencedtoconstructpositiverecombinantplasmid.TherecombinantplasmidwasusedastemplateforEvaGreenreal-timePCRtogeneratestandardcurveandmeltcurve.TheresultsshowedthatE

5、vaGreenreal-timePCRinthepresentstudywashighlyspecificwhileusedtodetectothernontargetviruses,anditssensitivitywasprovedtobe10copies/~tLandreproducibilityforbothintra—assayandinter—assaywerelessthan2.5%.Thentheestablishedmeth0dwasutilizedtotest118clinicalsamples.Theresultindicatedt

6、hatthePCV2positiveratewas25/118,whichwas99.2%consistentwiththatofconventionalPCRtests,exceptonesamplethatwaspositiveforPCV2byreal-timePCRbutnegativebyconventionalPCR.Thus,thismethodinthecurrentstudyshowedthecharacteristicsofspecificity,sensitivity,reproducibilityandsimpleoperatio

7、n,whichcouldbeusedinsubclinicaldiagnosisandepidemiologiealinvestigationofPCV2.Keywords:Porcinecircovirustype2EvaGreenReal—timePCRDetection猪圆环病毒2型(Porcinecircovirustype2,PC—DC)、猪皮炎与肾病综合征(Porcinedermatitisandv2)是近年来发现的一种重要的猪病病原,与在各地nephropathysyndrome,PDNS)、仔猪先天性震颤广泛流行的断奶仔猪多系统衰竭综合征

8、(Postweaning(Congenitaltremor,CT)及猪繁殖系统障

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