大豆主要过敏原Gly m Bd 30K抗原决定簇表征预测研究-论文.pdf

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1、第28卷第6期分析科学学报2012年12月VoL28No．6JOURNALOFANALYTICALSCIENCEDec．2Ol2文章编号：1006—6144(2012)06—0771—04大豆主要过敏原GlymBd30K抗原决定簇表征预测研究单晓红，孙秀兰“，管露，张银志，尤继明。，李红梅。(1．江南大学食品科学技术学院，江苏无锡214122；2．江南大学食品科学与技术国家重点实验室，江苏无锡214122；3．国家有机食品质量监督检验中心，江苏宝应2258OO)摘要：本文应用生物信息学技术，通过使用三种软件SOPMA、Swiss—model和DNAS

2、tar来预测大豆主要过敏原GlymBd30K的抗原表位，结果发现80—85、1O3—1O6、217-220、355—360这四段氨基酸残基序列是可能的抗原袁位，为后续的蛋白表位实验提供了依据，大大提高了工作效率。关键词：大豆；GlymBd3OK；抗原表位；生物信息学中图分类号：Q503文献标识码：A食品过敏反应是由过敏原引起的一类变态反应性疾病。而能引起过敏反应的食物目前主要有坚果、牛乳、鸡蛋、鱼、甲壳类水产动物、花生、大豆、小麦等八大类口]。大豆由于其丰富的营养价值，在人们的膳食摄入中占非常大的比例。由大豆引起的过敏反应在所有的食物过敏引起的变态反

3、应中约占1／4，其反应包括造成肠道损伤、胃部不适或过敏性皮炎等，严重时甚至会引起过敏性休克，进而威胁生命安全_2]。抗原表位有两种分类方法l_3]，按与抗原受体细胞结合不同，分为B细胞抗原表位和T细胞抗原表位；按表位结构不同分为线性表位和构象型抗原表位。目前对于过敏原抗原表位的预测主要是基于B细胞抗原表位的预测。由于抗原决定簇在蛋白质中的情况比较复杂，在预测与定位上存在着很大的困难。许多学者应用了多种方法来对其进行研究，包括采用酶解产生多肽片段进行尝试的方法、制备单克隆抗体筛选过敏原cDNA的方法、根据过敏原氨基酸序列设计重叠肽进行筛选的方法、构建噬

4、茵体展示文库筛选的方法、对蛋白质进行化学修饰或突变分析以及利用x射线和NMR分析等手段对过敏原上的表位进行的研究等等]。但是这些方法有诸如操作繁琐，难度较大，工作量大，效率低等缺点。生物信息学技术是目前新兴起的一门新技术，它通过整合与过敏原研究有关的分子生物学数据和相关的临床数据，在对这些基础数据收集、整理、对比的基础上开发出同源建模、蛋白质仿真、预测等技术，从而有效缩小抗原表位筛选的范围，大大减轻实验工作量，提高工作效率，可以使发现新表位的效率提高10～2O倍，节约大量研究经费并大大地加快新表位研究的进程_1。GlymBd30K也称为P34，属于半

5、胱氨酸蛋白酶的木瓜蛋白酶超家族的一个边缘成员。目前，抗原表位的预测一般采用采用多程序和多参数的综合预测，研究表明，这种方法可以大大提高预测的准确性口。本文主要通过生物信息学的方法，运用两种计算机软件多参数分析预测大豆过敏原GlymBd30K的蛋白结构和抗原表位，为大豆过敏原的进一步研究提供信息基础。收稿日期：201110—05修回日期：2011—11-02基金项目：“十二五”国家科技支撑计划(No．2011BAK10B03)；国家973项目(No．2012CB72o804)；2010年度公益性行业(农业)科研专项(No．201003008—08)；江

6、南大学自主科研计划(JUSRP21127)；江苏省质监局立项项目(Kj122704)*通讯作者：孙秀兰，女，博士，教授，主要从事食品安全检测方面研究。771第6期单晓红等：大豆主要过敏原Gly1TIBd30K抗原决定簇表征预测研究第28卷1实验部分I．1大豆主要过敏原GlymBd30K的氨基酸序列通过Pubmed网络服务器(http：／／www．ncbi．nlm．nih．gov／pubmed／)检索大豆过敏原的GlymBd30K氨基酸序列如下。mgflvlllfsllglsssssisthrsildldltkfttqkqvsslfqlwksehgrv

7、yhnheeeakrleitknnlnyirdmnanrksphshrlglnkfaditpqefskkylqapkdvsqqikmankkmkkeqyscdhppaswdwrkkgvitqvkyqggcgsgwafsatgaieaahaiatgdlvslseqelvdcveesegcyngwhyqsfewvlehggiatdddypyrakegrckankiqdkvtidgyetlimsdesteseteqaflsaileqpisvsidakdfhlytggiydgenctspyginhfvllvgygsadgvdywiaknswgedwgedgy

8、iwiqmtgnllgvcgmnyfasyptkeesetlvsarvk曲rrvdhspl1．2GlymBd