大豆中GmRAD与GmDIV基因的in silico鉴定及表达分析-论文.pdf

《大豆中GmRAD与GmDIV基因的in silico鉴定及表达分析-论文.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、分子植物育种，2012年，第10卷，第2期，第155—162页MolecularPlantBreeding，2012，Vo1．10，No．2，155—162研究报告ResearchReport大豆中GmRAD与GmD基因的scD鉴定及表达分析魏海超郝荣华李方正杨桂文冯献忠山东省高校系统生物学重点实验室，山东师范大学生命科学学院，济南，250014通讯作者，fengxianzhong@yahoo．corn；yanggw@sdnu．edu．ca摘要RAD与DIV属于MYB转录因子家族成员，在金鱼草研究中发现它们对花对称性的形成起着重要作用。本研究利用全基因组信息鉴定了大豆中的Gm

2、RAD与GmDIV基因，分析了其蛋白的理化性质、二级结构，基因结构与其在染色体上的分布，并对其系统发生和表达方式进行了研究。研究表明：大豆中存在5个GmRAD基因和5个GmDIV基因，它们分别属于MYB家族的Rl和R2R3类，分布在大豆的9条染色体上；进化分析显示GmRAD和GmDIV基因具有不同的进化历程，GmDIV比GmRAD基因更趋于单元发生：表达分析证明，GmDIV和GmRAD成员具有不同的表达模式，其中GmRAD3和GmRAD5以及GmDIV1、GmDIV3、GmDIV4和GmD，5在花组织中有较高的表达。关键词大豆，GmRAD基因，GmDIV基因，生物信息学分析，

3、花发育InsilicoIdentificationandExpressionAnalysisoftheGmRADandGmDlVGenesinSoybeanWeiHaichaoHaoRonghuaLiFangzhengYangGuiwen’FengXianzhongKeyLaboratoryofSystemsBiologyinUniversitiesofShandong，CollegeofLi~Science，ShandongNormalUniversity，Jinan，250014Correspondingauthors．fengxianzhong@yahoo．tom；ya

4、nggw@sdnu．edu．cnDOI：10．3969／mpb．010．000155AbstractTwoMYBtranscriptionfactors，RADIALIS(RAn)andD1VARICATA(DIV)，playanimportantroleinthecontrolofflowersymmetryinAntirrhinum．Inthisstudy,GmRADandGmDIVgenesinsoybeanwereidentifiedthroughagenome—widebioinformaticsanalysis．Thebiochemicalpropertiesan

5、dsecondarystructuresoftheirproteins，aswellastheirgenestructuresandtheirdistributionsinchromosomeswereallanalyzed．Theirphylogenyandexpressionpatternwerealsoinvestigated．ThisresearchshowsthatinsoybeantherearefiveGmRADgenesandfiveGmDIVgenes，whichbelongtoR1classandR2R3classofMYBfamilyrespective

6、ly,andtheyaredistributedinninechromosomesofsoybeangenome．PhylogeneticanalysisindicatesGmRADgenesandGmDIVgenesevolvedthroughdiferentpathsduringspeciation，andGmDIVgenesaremorelikelytooriginatedfrommonophylesisthanGmRADgenes．Expressionanalysisshowsthatmembersofthesegeneshavediferentexpressionp

7、atterns，andGmRAD3，GraRAD5，GmDIV1，GmDIV3，GmDIV4arehighlyexpressedinsoybeanflowers．KeywordsSoybean(Glycinemax)，GmRADgene，GmDIVgene，Bioinformaticsanalysis，Flowerdevelopment花是被子植物进行有性繁殖的主要器官，千姿百经过多次反复独立进化而来(Endress，1999；Stebbins，态的花型是植物吸引动物传媒和被特异授粉者识别1974)。研