大豆盐胁迫相关gmnac基因的鉴定、表达及变异分析

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1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2016,42(7):990999http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2016.00990大豆盐胁迫相关GmNAC基因的鉴定、表达及变异分析1,211111,张彦威张礼凤李伟王彩洁张军徐冉12山东省农业科学院作物研究所,山东济南250131;东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨150001摘要:NAC基因在植物的逆境胁迫

2、中发挥着重要作用。本研究参照水稻和拟南芥的逆境相关NAC基因,采用生物信息学方法鉴定了大豆逆境相关GmNAC基因,利用荧光定量PCR技术分析了GmNAC基因在耐盐差异的大豆品种根部、叶片的表达及其对NaCl胁迫的应答,采用反转录PCR技术克隆了表达差异显著的GmNAC基因。结果表明,大豆GmNAC基因家族包含175个基因,其中11个基因所编码的GmNAC蛋白与水稻和拟南芥的逆境相关NAC蛋白位于同一进化分支,这些蛋白具有高度保守的NAC结构域;这11个GmNAC基因在大豆根部的表达均高于在叶片,而且在叶片和根部均受NaCl诱导,部分基因在根部和叶片以及品种间

3、表现出不同的表达规律;在大豆品种齐黄34、徐豆10和汾豆95中,Glyma06g11970.1存在3个同义突变和1个非同义突变,Glyma06g16440.2存在1个同义突变。关键词:大豆;GmNAC;进化树;NaCl处理;表达分析;序列变异Identification,ExpressionandVariationAnalysisofSaltToleranceRelatedGmNACGenesinSoybean1,211111,ZHANGYan-Wei,ZHANGLi-Feng,LIWei,WANGCai-Jie,ZHANGJun,andXURan12Cr

4、opResearchInstitute,ShandongAcademyofAgriculturalSciences,Jinan250131,China;KeyLaboratoryofSoybeanBiologyofMinistryofEducation,NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150001,ChinaAbstract:NACgenesplayanimportantroleinplantstresstolerance.Inthisstudy,bioinformaticmethodwasusedtoidenti

5、fythestressrelatedGmNACgeneinsoybean.TheexpressionofcandidatedGmNACgenesinrootandleafwasanalyzedinsoybeanwithNaCltreatmentbyReal-timePCR.ReversetranscriptionPCRwasperformedtoclonegeneswithsignificantdifferenceinexpression.Theresultsshowedthattherewere175genesinsoybeanGmNACgenefamil

6、y.Therewere11GmNACproteinswithhighlyconservedNAClocatedonthesameevolutionarybranchwiththestressrelatedNACproteinsinriceandArabidopsis.Theexpressionof11GmNACgenesinsoybeanrootwashigherthanthatinleaf.TheGmNACgeneswereallinducedbyNaClstress,butpartoftheGmNACgenesshoweddifferentexpress

7、ionlevelsbetweenrootandleafinsoybeanvarietieswithdifferentsalttolerances.Therewerethreesynonymousmutationsandonenon-synonymousmutationontheCDSregionofGlyma06g11970.1andonesynonymousmutationontheCDSregionofGlyma06g16440.2inQihuang34,Xudou10,andFendou95.Keywords:Soybean;GmNAC;Phyloge

8、netictree;NaCltreatment;Ex

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