猪apoe基因外显子4的多态性分析

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1、江西农业大学学报2010，32(4)：0647—0650http：／／xuebao．jxau．edu．cnActaAgricuhuraeUniversitatisJiangxiensisE—mail：ndxb7775@sina．com猪APOE基因外显子4的多态性分析李仕新，高萍，陈赞谋，张豪，李加琪(1．华南农业大学动物科学学院，广东广州510642；2．仲恺农业工程学院，广东广州510225)摘要：生物的寿命受到遗传和环境的影响，利用模式生物对衰老相关基因的研究已取得显著成果。母猪利用年限作为一个复杂的适应性性状，与寿命直接相关。母猪的利用年

2、限缩短会导致母猪群的繁殖寿命缩短。本研究根据比较基因组学和生物信息学，以猪APOE基因作为影响母猪利用年限的重要候选基因，研究了长白和大花白两个猪种的APOE基因外显子4的多态性并对不同基因型及基因频率作统计分析。结果表明：猪APOE基因外显子4的第227位碱基发生了c—T转换，这一变异导致相应蛋白质序列中的氨基酸发生了亮氨酸和脯氨酸替换。该位点基因型：大花自CC型频率为42％，CT型频率为30％，TY型频率为28％，而长白猪CC型为100％。长白母猪与大花白母猪的利用年限差异较大，而猪APOE基因外显子4等位基因频率的差异可能说明了两者之间的利

3、用年限差异的原因。关键词：猪；母猪利用年限；APOE；~'b显子；单核苷酸多态性中图分类号：$828．212文献标志码：A文章编号：1000—2286(2010)04—0647—04TheSingleNucleotidePolymorphismofthePorcineAPOEExon4LIShi．xin，，GAOPing，CHENZan．mou，ZHANGHao，LIJia．qi(1．CollegeofAnimalScience，SCAU，Guangzhou510642，China；2．CollegeofLifeSciences，Zhongkai

4、UniversityofAgricultureandEngineering，Guangzhou510225，China)Abstract：Longevityisdependentongeneticsandenvironmentalfactors．ManySignificantresultshavebeenachievedbyusingmodelorganismsforthestudyonaging—relatedgenes．Sowlongevity，asacomplexa-daptivetrait，isdirectlyassociatedwith

5、li~span．ReducingSOWlongevityleadstoshortenedproductivelife．Basedoncomparativegenomicsandbioinformatics，theporcineAPOEgenewasregardedasthecandidategeneofSOWlongevityandthepolymorphismofthegeneexon4wasstudiedinthisstudy．Also，thegenotypeandallelicfrequenciesforDahuabaiandLandrac

6、eporcineAPOEgeneexon4werecalculated．Theresultswereasfollows：the227bpofbaseCwasreplacedbybaseTinporcineAPOEgeneexon4，whichledtothechangeofaminoacidfromleucinetoproline．ThegenotypefrequenciesofthesamepolymorphiclocusstatedabovewereCC42％，CT30％andTr28％inDahuabai，whileCCtotallyl00

7、％inLandrace．AsthereisdiferenceinproductivelifebetweenLandraceandDahuabaiSOWS，thedifferentalleliefrequenciesinporcineAPOEgeneexon4betweenthetwobreederssuggestthatitmaybethecauseofthedifferenceinSOWlongevity．Keywords：SOWlongevity；apolipoproteinE(APOE)；singlenucleotidepolymorphi

8、sm(SNP)有研究表明母猪较长的利用年限(从第一胎至淘汰)和较低的淘汰率能带来良好的经济效益卜2。因此母猪的利用年限是值得关注的性状。