中国西北6个地方绵羊品种mtdna的遗传多样性研究

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1、江西农业大学学报2010,32(4):0637—0642http://xuebao.jxau.edu.cnActaAgricuhuraeUniversitatisJiangxiensisE—mail:ndxb7775@sina.com中国西北6个地方绵羊品种mtDNA的遗传多样性研究霍俊宏,武艳平,关伟军,谢金防,万明春,马月辉(1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;2.江西省农业科学院畜牧兽医研究所,江西南昌330200)摘要:基于PCR—SSCP和克隆测序技术,分析了西北6个绵羊品种的群体内和群体间的遗传变异,通过对DNA序列的多重比对,得出A、B、C3种单倍型,在

2、D~loop区内的碱基替换全部为转换;绵羊mtDNAD—Loop区中存在着明显的长度变异,引起变异原因主要是由于1个或几个碱基或串联重复基元序列的插入(或缺失)造成的,不存在绵羊品种特异性;本试验研究的绵羊在各个不同片段中所扩增出的A、B、C3种单倍型基本一致,但不是完全连锁,存在着微小的差异;用NJ法构建了系统进化树,可明显看出中国6个绵羊品种3种单倍型的分类情况,单倍型树表明新疆的巴音布鲁克羊和卡拉库尔羊之间的遗传关系最近。关键词:绵羊;mtDNA;遗传多样性中图分类号:$826.212文献标志码:A文章编号:1000—2286(2010)04—0637一o6AStudyonmtDN

3、AGeneticDiversityof6NativeSheepBreedsinNouthwestChinaHUOJun—hong,WUYan—ping,GUANWei-jun,XIEJin—fang,WANMing.chun,MAYue—hui(1.InstituteofAnimalScience,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100193,China;2.In—stituteofAnimalScience,JiangxiAcademyofAgriculturalSciences,Nanchang330200,China)Abst

4、ract:Thestudyanalyzedthegeneticvariationwithinpopulationandamongpopulationsof6sheepbreedsbasedonPCR—SSCPandsubsequentclonesequencingprotocols.ComparisonofthemtDNAse·quencesshowedthatallthereplacementsubstitutionsofbasepairsinD—LoopbetweenthehyplotypesA,BandC,aretransitionsalone;lengthvariationini

5、nsertionordeletionofbasepairortandemlyrepeatedse—quenceinD—Loopwasfoundinthesixsheepbreeds;hyplotypesA,BandCwerebasicallyinthesamelink—ageinthesixsheepbreedswithafewexceptions;phylogenetictreesofNJsuppo~theclassificationofthreehyplotypesinthesixsheepbreedsinChinaandBayinbulukesheepandKalakuershee

6、phadacloserrelation。shipcomparedtoothers.Keywords:sheep;mtDNA;geneticdiversity生物多样性(biodiversity)是生命有机体及其借以存在的生态复合体的多样性和变异性,是所有生物种内遗传变异和它们生存环境的总称,包括所有不同种类的动物、植物、微生物及其它们所拥有的基因,还有它们与生存环境所组成的生态系统。随着遗传变异的不断积累,遗传多样性的内容也就不收稿日期:2010—04—16修回日期:2010—06—03基金项目:国家自然科学~(30371026)和国家“十五”科技攻关项目(2004BA514A09)作者

7、简介:霍俊宏(1975一),男,助研,硕士,主要从事畜禽遗传育种研究,E—mail:huojunhong0222@tom.com;通讯作者:马月辉,研究员,博士生导师,E—mail:yuehui.ma@263.net。·638·江西农业大学学报第32卷断地得到丰富。而遗传多样性贫乏的物种,通常在进化上的适应性就弱,即群体内的遗传变异反映了物种的进化潜力_3]。当前国外畜种遗传多样性日趋缩小,畜种资源日趋贫乏、单调。中国家养动物的丰富

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