利用mtdna+d-loop区的研究10个绵羊品种遗传多样性、起源及遗传分化

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1、≥。l:;,黟ShandongAgriculturalUniversityDissertationforMasterDegreeGeneticdiversity,originandgeneticdifferentiationoftensheepbreedsusingmitochondrialDNAD.100pregionCandidate:YanbinGuoMajor:AnimalBreedingAndGeneticsSpecialty:AnimalMolecularGeneticBreedin

2、gSupervisor:Prof.HuiWang2010.06.13一!\二..甍.∥通.抄t彳v哩-l≯X;.r:,k叠疆薯琴一关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文,是在导师指导下,独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体,均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。本人完全了解山东农业大学有关保留和使用学位论文的规定,同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以

3、将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。保密论文在解密后应遵守此规定。论文作者签名:帮秀麦认导师签名:3-玺B强。-/9tz.哗一一气I符号说明英文缩略词英文全称中文全称-◆童k●▲p月,“f,}●嚏,我v●,吲一目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯1ABSTRACT⋯.⋯..⋯.⋯..⋯⋯⋯⋯.⋯.⋯⋯..⋯.⋯..⋯⋯⋯.....⋯......⋯.......⋯⋯.⋯⋯⋯.:}1引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.51.1动物mtDNA的结构与基本特性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..51.1.1mtDNA的结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.51.1.2mtDNA的基本特性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..61.2利用DNA序列构建系统进化树的方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..81.2.1距离法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯91.2.2最大简约法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..101.2.3最大似然法⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。1O1.2.4不同构树方法的优缺点⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯111.3利用mtDNA研究动物起源与进化的研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..121.3.1MtDNA在动物起源与进化研究中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯121.3.2利用mtDNA探讨绵羊起源的研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯131.4绵羊mtDNA遗传多样性研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯161.4.1利用mtDNA研究绵羊遗传多样性的方法⋯⋯⋯⋯⋯...⋯..161.4.2利用mtDNA研究绵羊遗传多样

6、性的进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯171.5本研究的主要内容和目的意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..192材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..202.1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯202.1.1实验动物⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯_⋯⋯...⋯202.1.2主要仪器设备⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯....⋯⋯⋯202.1.3主要试剂及常用试剂配制⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...⋯.202.2实验方法⋯⋯⋯⋯⋯

7、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.222.2.1绵羊血液DNA的提取及检测⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。22。2.2.2引物设计和mtDNAD.100p区的扩增⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.232.2.3PCR产物的回收、纯化与测序⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯232.3试验数据的统计分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.243结果与分析⋯⋯⋯⋯⋯...⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯25k,I3.1PCR扩增及测序结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯253.2

8、10个绵羊品种mtDNAD.100p区的全序列差异⋯⋯⋯⋯⋯⋯.263.2.1所测绵羊个体D.100p区全序列的长度⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯263.2.210个绵羊品种mtDNAD.100p区的碱基组成⋯⋯⋯⋯⋯263.310个绵羊品种遗传多样性分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.263.3.1单一多态位点⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯273.3.2简约信息位点⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。283.3.3mtDNAD.100p区序列多态性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯283.410个绵羊品种遗传距

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