我国部分黄牛品种线粒体D-loop区遗传多样性与起源分化

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1、篷HEREDITAS(Beijing)2009年2月，31(2)：160—168ISSN0253-9772WWW．chinagene．ca研究报告DoI：10．3724，sP．J．1005．2009．00160我国部分黄牛品种线粒体D-loop区遗传多样性与起源分化张桂香，郑友民，王志刚，韩旭，贾善刚，陈宏1．全国畜牧总站，北京100125；2．西北农林科技大学动物科技学院，杨凌712100摘要：为了解我国地方黄牛品种线粒体DNA的遗传变异情况，文章测定了16个地方黄牛品种206个个体线粒体D—loop区的全序列，共检测到10

2、1个变异位点；99种单倍型，其中73种是普通牛单倍型，26种是瘤牛单倍型；平均核苷酸差异为22．6920，单倍型多样度为0．9320，核苷酸多样度为0．0227，表明我国黄牛品种遗传多样性非常丰富。构建的NJ进化树显示16个品种来源于两大母系：普通牛和瘤牛；构建的Network图表明73种普通牛单倍型可以分为3大单倍型群；26种瘤牛单倍型分为5种单倍型群，推测我国瘤牛在迁移过程中，至少经历了4次群体扩张事件通过分析比较地方黄牛品种与内罗门牛共有的H3单倍型，发现其中只有16％的序列与内罗门牛的H3单倍型非常相似，其余84％的序

3、列均发生了乌嘌呤变异，推测这些变异很可能是我国瘤牛固有的变异。关键词：黄牛；D—loop区；遗传多样性；起源；分化GeneticdOiversityandorilginofmitochondariaDNAD-hlOOpregRi1oOnofsomeChineseindigenouscattlebreedsZHANGGui—Xiang，ZHENGYou—Min，WANGZhi—Gang，HANXu，JIAShan—Gang，CHENHong1．NationalAnimalHusbandryService，BeOing100125

4、，China；2．CollegeofAnimalScienceandTechnology，NorthwestA＆FUniversity．Yangling712100．ChinaAbstract：111ecompleteD—loopregionofmitochondrialDNAfrom206individualsin16ChineseindigenouscattlebreedswassequencedandanalyzedtodetectvariabilityofD—loopregionofmitochondriaDNAfor

5、thosebreeds．There—suitsshowedasfollows：101variationsand99haplotypeswerefound，inwhich73haplotypeswereofBostaurusandtheother26haplotypeswereofBosindicus，andtheaveragenumberofnucleotidedifferenceswas22．6920，haplotypediversitywas0．9320，andnucleotidediversitywas0．0227，in

6、dicatinghighgeneticdiversityinChineseindigenouscattlebreeds．Ac-cordingtotheNJphylogenetictree．16cattlebreedsweredividedintotwoclades．BOStaurusandBosindicus．BasedontheNetworkgraphics，the73haplotypesofBostauruswereclassifiedinto3groupsandthe26haplotypesofBosindicuswer

7、eclassifiedinto5groups．ItwasinferredthatcattlebreedsofBosndicusinChinahadexperiencedatleast4populationex—pansionsduringtheirmovement．Therewasonly16％ofH3haplotypesequnencessimilartothesequenceofNellore，and84％ofthosesequnenceshadpurineCvariationinChineseindigenouscatt

8、lebreedsthroughtheanalysisontheircommon收稿日期：2008—05—05；修回13期：2008—07—13基金项目：农业部中国地方牛品种遗传距离测定项目(编号：农财发12002]9号)资助作者简介：张桂香(1972一)，女，博士，研究方向：