基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系-论文.pdf

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1、，参麓_onlines意■嫩■拣燎一麓ystem：http：Hww若w．iabiotechorggy黥尝嚣浆酝l==基于线粒体基因组D．1oop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系高玉时贾晓旭唐修君唐梦君樊艳风陆俊贤顾荣葛庆联苏一军江苏省家禽科学研究所扬州I225125通讯作者，gaoysl00@sina．COIll摘要本研究旨在探究江西安义瓦灰鸡(Gallusgallusdomestiaus)的遗传多样性和起源。对30只安义瓦灰鸡线粒体基因组(mitochondrialgenome，mtDNA)D．1oop区全序列的进行PC

2、R扩增和测序(GenBank登录号：KP893677～KP893682)，并结合GenBank中红色原鸡的D1oop区序列，分析安义瓦灰鸡线粒体多态性及其起源。结果发现，安义瓦灰鸡mtDNAD．1oop区全长1231～1232bp，核苷酸多样性)为(O．00613+0．00014)，单倍型多样性(rid)为(0．837~0．027)。在30只个体中，共发现18处单核苷酸多态位点，6种单倍型。系统发育分析发现，6种单倍型可以分为A、B、C3个分支，其中C为主要分支，有3种单倍型，A分支有1种倍型，B分支有2种倍型。A和B分支与红色原鸡滇南亚

3、种(Gallusgallusspadiceus)聚为一类，C分支与4个原鸡亚种聚为一类。研究结果表明，安义瓦灰鸡mtDNAD—loop区有丰富的多态性，并且有多个母系起源，从分子水平上为安义瓦灰鸡的遗传资源保护和开发利用提供了参考。关键词安义瓦灰鸡，线粒体DNA，D—loop区，系统发育关系，起源TheGeneticDiversityandOriginAnalysisofAnyiTile-likeChickens(Callusgallusdomestiaus)BasedonMitochondrialDNAD—loopSequenceGAO

4、Yu—ShiJIAXiao—XuTANGXiu—JunTANGMeng—JunFANYan—FengLUJun-XianGURongGEQing—LianSUYi—JunJiangsuInstituteofPoultryScience，Yangzhou225125，ChinaCorrespondingauthor．gaoys100@sina．comAbstractThisstudysoughttoassessmitochondrialDNA(mtDNA)diversityandoriginofJiangxiAnyiTile—likeChi

5、ckens(Gallusgallusdomestiaus)．Bloodsampleswerecollectedfrom30chickens．ThecompletesequenceofthemtDNAD-loopwasPCRamplifiedandsubsequentlysequenced(GenbankaccessionNo．KP893677-KP893682．)．DNAsequenceofmtDNAD—loopoffiveredjunglefowlsubspecieswerecollectedfromtheGenBankanduseda

6、sreferencesequences．Theresultsshowedthat，theD-loopregionofAnyiTile—likeChickenswas1231-1232bpinlength．Thenucleotidediversitywas(0．006134-0．00014)，andthehaplotypediversitywasf0．837~0．027)．The6haplotypeswereobservedbasedon18mutantsiteandclusteredintothreeclades(A，B，andC)，of

7、whichcladeCwasdominant．ThreehaplotypesbelongtocladeC，twohaplotypesareincladeB．oneisincladeA．ThecladeAandcladeBwereclusteredwithGallusgallusspadiceus，cladeCwasclusteredwithfoursubspeciesofredjunglefow1．TheseresultsshowahighmitochondrialD．1oopdiversityandindicatemultiplemat

8、ernaloriginsforAnyiTile-likeChickens．Theresults基金项目：国家自然科学基金(No．31372277)收稿日期：2014．12．30接受日期：201