鲁西黑头羊mtdna d―loop区遗传多样性与遗传分化研究

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1、鲁西黑头羊mtDNAD―loop区遗传多样性与遗传分化研究  摘要:鲁西黑头羊是一个优良的绵羊培育品种,具备高产肉力和高繁殖力特征。为了评估这个品种线粒体DNA的遗传多样性,同时获得该新品种界定的分子证据,本研究对鲁西黑头羊、杜泊羊和小尾寒羊mtDNA的高变异区进行了测序,分析了它们的遗传多样性和遗传分化,并计算了鲁西黑头羊与其它两个品种间的遗传距离。结果表明:三个品种的遗传多样性较为丰富,遗传分化程度较高(Fst为0.3240~0.5909);鲁西黑头羊与杜泊羊之间的遗传距离为0.1187,达到了种间的遗传距离,与小尾寒羊之间的

2、遗传距离为0.0654,达到了亚种间的水平。以上结果为鲁西黑头羊的品种界定提供了数据支持。  关键词:鲁西黑头羊;mtDNA;D-loop区;遗传多样性;遗传距离  中图分类号:S826.212文献标识号:A文章编号:1001-4942(2016)09-0115-04  AbstractLuxiblackheadsheepisanexcellentcultivatedbreedwithhighyieldofmeatandhighprolificacy.ToassessthegeneticdiversityofLuxiblackhe

3、adsheeponmtDNAandobtainthemolecularevidenceonbreedidentification,thehypervariableregionsofmtDNAinLuxiblackheadsheep,DorperandsmalltailHansheepweresequenced,andtheirgeneticdiversity,genetic8differentiationandgeneticdistancewereanalyzed.Theresultsindicatedthatthegenetic

4、diversityamongthreebreedswasrichandthedegreeofgeneticdifferentiationwashigh(Fstas0.3240~0.5909).ThegeneticdistancebetweenLuxiblackheadsheepwithDorperwas0.1187,whichreachedthevaluebetweenspecies;andthatwithsmalltailHansheepwas0.0654,whichreachedthevaluebetweensubspecie

5、s.TheresultsprovideddatasupportforthebreedidentificationofLuxiblackheadsheep.  KeywordsLuxiblackheadsheep;mtDNA;D-loopregion;Geneticdiversity;Geneticdistance  鲁西黑头羊是利用杜泊羊作父本、小尾寒羊作母本,经过级进杂交、横交固定、继代选育和扩繁而培育形成的肉用绵羊新品种。该品种头颈部被毛黑色,体躯被毛白色,体格大、结构匀称、背腰平直、后躯丰满,肉用体型明显;6月龄公羔体重达到

6、(45.75±3.70)kg,6月龄母羔体重达到(43.76±6.03)kg;平均产羔率220%,屠宰率55.1%,具有生长速度快、繁殖率高、耐粗饲、羊肉品质好等优良特性,颇受市场欢迎。  动物线粒体DNA(MitochondrialDNA,mtDNA)是动物体内唯一的核外遗传物质,具有母系遗传的特征,结构简单稳定、进化速度较快,而且能直观保存群体突变的发生[1,2]。Fan等[3]对不同尾型的绵羊mtDNA基因组进行了测序,分析了不同尾型品种间的系统进化关系。Zhao等[4]利用mtDNA测序方法分析了中国绵羊品种的遗传多样性和

7、品种间遗传变异情况。本研究拟通过对鲁西黑头羊、杜泊羊和小尾寒羊mtDNA8D-loop区进行测序,分析它们的遗传多样性和遗传变异,计算鲁西黑头羊与其它两个品种间的遗传距离,以期为鲁西黑头羊的品种界定提供数据支持。  1材料与方法  1.1样品采集  选择健康的无亲缘关系的羊群,随机抽测杜泊羊8只、小尾寒羊10只(后期有1只样品不能用)、鲁西黑头羊10只,均为成年羊,公母各半。利用EDTA抗凝管颈静脉采血5mL,-20℃保存备用。  1.2试验方法  1.2.1基因组DNA提取采用生工生物工程(上海)股份有限公司的EZUP柱式动物基

8、因组DNA抽提试剂盒提取血液基因组DNA。-20℃保存。  1.2.2PCR扩增本试验所使用的D-loop区引物序列,F:5′-AGCCCCACTATCAACACC-3′;R:5′-AAATAGTTACCCCCACAGTTAG-3′。  PCR扩增

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