模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展.pdf

《模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、物理化学学~(WuliHuaxueXuebaol842ActaP．一Chim．Sin．2013，29(9)，1842-1850September【Review】doi：10．3866／PKU．WHXB201307011WWW．whxb．pku．edu．cn模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展吴晓敏，袁晓辉。薛书蕾’查岭生’王光利’张海军(淮北师范大学生命科学学院，资源植物生物学安徽省重点实验室，安徽淮北235000；东北林业大学生物资源生态利用国家地方联合工程实验室，哈尔滨150040；

2、暨南大学生物医药研究院，广州510632)摘要：蛋白质折叠是目前结构生物学领域的核心问题之‘，理解蛋白质结构折叠机制及其生物功能之间的桐匝关系‘卣趋生命科学家非常重要的研究内容，并且该研究受到越来越多／1同学科领域研究工作者的高度视．蚩质大多数在数_十‘毫秒、微秒或几秒内完成自我折叠过程，但其折叠过程中所发生的分子结构精细转变却纳秒甚史短时间尺度内完成．由于其折叠时间分辨率的限制，目前无论足从常规实验还是理论计算角度对其研究部存在一定的难度．本文首先概述了蛋白质折叠研究在实验和理论模拟方面存存的些

3、问题，然后以结构典型且町快速折叠的人工设计多肽Trp-cage为例，主要对其折叠过渡温度、折叠形成模型及其肽链关键氨基酸饯基存折叠过程中的作用二个方面进行了详细讨论，综述了模型多肽Trp—cage的折叠动力学行为分别实验和理论模拟方面的研究进展．最后就如何有效化解蛋白质残基间相互作用网络进而降低其折叠机制的复杂性提出了一些新的建议，不仅有助于阐明该迷你蛋白Trp—cage快速折叠、稳定形成的驱动力成冈，而H也能为蛋F1质折叠机制研究和多肽设计提供有益参考．关键词：实验与理论模拟：折叠机制：过渡温度

4、：残基突变：关键氨基酸中图分类号：O641ResearchProgressoftheTrp-CageFormationandItsFoldingMechanismWUXiao．Min’，+YUANXiao．Hui。XUEShu—Lei’ZHALing—Sheng’WANGGuang—Li’ZHANGHai．Jun’，(。KeyLaboratoryofResourceandPlantBiologyofAnhuiProvince,CollegeoilScience，HuaibeiNormalUnive

5、rsity,Huaibei235000,AnhuiProvince，PR．China；NationalLocalJointEngineeringLaboratoryofBio—resourceEcologicalUtilization，NortheastForestryUniversity,Harbin150040,R．China；InstituteofBiomedicine,JinanUniversity,Guangzhou510632，PR．China)Abstract：ProteinfoId

6、ingiSconsideredoneofthemostimportanttopicsinstructuraIbiology．Anin-depthunderstandingofthefoIding．functionrelationshipiSoneofthemostimportantsubjectsforbiologists．andiSofinteresttoscientificresearchersinotherdisciplines．ThefoIdingofproteinsiSoftencomp

7、letedwithintheorderofmillisecondstoseconds，whereastheunderlyingatomisticdetailscorrespondingtostructuraIalterationsandintermolecularlnteractionsoftenoccuronthenanosecondorevensmallertimescales．Accordingly．theunambiguousdescriptionofcomplicatedfoIdingb

8、ehaviorsremains{naccessibletoroutineexperimentalandtheoretically-calculatedresolutions．Inthispaper．wereviewtheproblemsthatexistinrecentexperimentalandReceived：February26，2013：Revised：June28，2013：PublishedonWeb：July1，2013．Correspondingauthors．W