苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系优化及应用比较.pdf

《苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系优化及应用比较.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、南方农业学报JOURNALOFSOUTHERNAGRICULTUREISSN2095—1191；CODENNNXAABhttp：／／www．nfnyxb．coinDOI：10．39696：issn．2095-1191．2013．2．195苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系优化及应用比较琚茜茜1，2．一，黄如葵2'3+，黄玉辉2一，刘萌芽1,2,3冯诚诚2'3(1广西大学农学院，南宁530005；2广西农业科学院蔬菜研究所，南宁530007；3广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室，南宁530007)摘要：【目的】优化

2、苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系，比较这两种分子标记在苦瓜应用中的优劣，为苦瓜突变体筛选提供参考。【方法】以8份苦瓜种质为材料，对AFLP和SRAP反应体系中各反应因素浓度进行筛选优化；分别选取5对条带清晰、重复性好的AFLP和SRAP弓I物对8份苦瓜材料进行扩增，比较其多态性。【结果】在AFLP反应体系中，在0～1嘴稀释范围内，以连接产物稀释5倍时反应效果较好；将预扩产物稀释3皓进行选择性扩增为宜。在SRAP反应体系中，M92+浓度为2．5mmol／L、dNTP浓度为0．2mmol／Lltv]"，反应效果较好。多

3、态性分析结果显示，5对AFLP引物共扩增出145条带，多态性条带有18条，多态性比率为12．41％；5XgSRAP弓I物扩增条带数为109条，其中多态性条带数有9条，多态性比率为8．25％。【结论】AFLP和SRAP两种分子标记技术均可以很好反映苦瓜种质资源的遗传多样性，但AFLP扩增产物的平均多态性高于SRAP，能够比较稳定地筛选出差异条带。关键词：苦瓜；AFLP；SRAP；多态性；比较中图分类号：$642．5文献标志码：A文章编号：2095—1191(2013)02—0195—05OptimizationofPCRr

4、eactionsystemsofAFLPandSRAPforMomordicacharantiaL．andtheirutilizationcomparisonJUXi—xi1，2”，HUANGRu-kui2，”，HUANGYu-hui2⋯，LIUMeng-yal’2⋯，FENGCheng—cheng2，3(1AgriculturalCollege，GuangxiUniversity，Nanning530005，China；2VegetableResearchInstitute，GuangxiAcademyofAgricu

5、lturalSciences，Nanning530007，China；3GuangxiCropGeneticImprovementandBiotechnologyLab，Nanning530007，China)Abstract：【Objective】Toprovidereferencesforselectingbittergourdmutants，AFLPandSRAPreactionsystemswereoptimizedandtheirprosandconswerecompared．【Method】Screening

6、theconcentrationofallthereactionfactorsinthemethodofsingle-factoranalysisandmakingfurtheroptimizationforAFIJPandSRAPsysteminM．charantia．andfivepairsofcleared-bandandreproducibleprimerswereselectedtoamplifytheeightsamples，andthentheirpolymorphismwascompared．【Resul

7、t】Itwasbettertodilutetheconnectingproductforfivetimesandpre—amplificationproductfor30timesintheAFLPreactionsystemandtobe2．5mmol／LforM矿concentration，and0．2mmol／LfordNTPconcentrationintheSRAPreactionsystem．Theresultofpolymorphismanalysisshowedthat145bandswereamplif

8、eidfrom5parisofAFLPprimers，ofwhich18werepolymorphic；while5parisofSRAPprimersproduced109bandswith9beingpolymor-phic．Furthermore，thepolymorphismrateinAFLPdetecti