威海地区幽门螺杆菌cagA基因3′端多态性分析.pdf

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1、中国病原生物学杂志2014年9月第9卷第9期JournalofPathogenBiologySeptember2014,Vo1.9,No.9DOI:10.13350/j.cjpb.140904威海地区幽门螺杆菌.L』荽—乍cagA基因3端多态性分析*杜东龙,孙万菊,孙辉,刘岩红,李波清一(1.滨州医学院病原生物学教研室,山东烟台264003;2.滨州医学院附属医院呼吸内科,山东滨州256603)【摘要】目的研究威海地区幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)临床分离株cagA基因的3端多态性。方法采用PCR法扩增Hp临床分离株的cag

2、A基因3端并测序,用DNAStar5.0软件对其进行编码氨基酸序列的比对分析。结果63株Hp临床分离株均cagA阳性(cagA),其中93.7(59/63)为东亚型(EPIYYA—ABD),6.3(4/63)为西方型(EPIYYA—ABC)。3.4(2/59)的东亚型菌株EPIYA-B突变为ESIYA-B,4株西方型型均突变为EPIYT—B。胃癌患者分离株中88.9(16/18)为东亚型,11.1(2/18)为西方型;非胃癌分离株中95.6%(43/45)为东亚型,4.4(2/45)为西方型。2株分离自胃癌患者的西方型HpEPIYA-A后的第一个氨基

3、酸残基由赖氨酸(K)突变为谷氨酸(E)。结论威海地区HpcagA基因以东亚型为主,但东、西方亚型Hp的致病性无显著差别,两型都存在cagA基因3端编码氨基酸序列的改变。【关键词】幽门螺杆菌;cagA;多态性【中图分类号】R378.911【文献标识码】A【文章编号】1673—5234(2014)09—0783~05[JournalofPathogenBiology.2014Sep;9(9):783—787.]Analysisofthe3regionofcytotoxin—associatedgeneA(cagA)inHelicobacterpylori

4、isolatesfromWeihaiDUDong—long,SUNWan-ju,SUNHui,LIUYan—hong,LIBo—qing(1.Dep。rtme,zt0fPnth0g彻Biology,BinzhouMedicalUniversity,Yantai,Shandong264003,China;2.DepartmentofRespiratoryMedicine。AffiliatedHospitalofBinzhouMedicalUniversity,Binzhou,Shandong256603,China)[Abstract]Objectiv

5、eTocharacterizethevariantsofthe3regionofcytotoxin—associatedgeneA(cagA)inHelicobacterpyloristrainsisolatedfromWeihai.MethodsThe3regionofthecagAgenewasamplifiedwithPCR.andthentheproductsweresequencedandtheaminoacidsequenceswereanalyzedwithDNAStar5.0software.ResultsSixty-threeH.p

6、yloristrainswerecagA—positive(cagA。。).cagAproteinin93.7(59/63)ofthesestrainswastheEastAsiantype,anditstyrosinephosphOrylationmotif(TPM)wasEPIYA-ABD.cagAproteinintheremainingstrains(6.3,4/63)wastheWesterntype,anditsTPMwasEPIYA—ABC.cagAproteinin3.4(2/59)ofthestrainswastheEastAsi—

7、antypebutitsmotifhadchangedtoESIYA—B,whereasWestern-typecagAproteininall4strains(100)hadamotifofEPIYT—B.Ofthestainsisolatedfrompatientswithgastriccancerinthisstudy,88.9%(16/18)hadEastAsian—typeca—gAproteinwhiletheremaining11.1(2/18)hadWestern—typecagAprotein.Ofthestrainsisolate

8、dfrompatientswith—outgastriccancer,95.6(43/45)hadEastA

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