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时间:2020-03-24
《凡纳滨对虾HSP10基因序列与低温表达分析.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、南方农业学报JOURNALOFSOUTHERNAGRICULTURE2013,44(5):838—843ISSN2095—1191:CODENNNXAABhttp://wnuw.nfnyxb.CBDOI:10.3969/j:issn.2095—1191.2013.5.838凡纳滨对虾HSPl灌因序列与低温表达分析彭金霞,韦嫔嫒,殷勤,蒋小珍,黎铭,陈晓汉+(广西水产研究所/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,南宁530021)摘要:【目的】克隆分析凡纳滨对虾HSPlo基因,为研究其在寒冷耐受过程中
2、发挥调控功能提供参考依据。【方法】搜索EST库获得凡纳滨对虾HSPlD基因序列,再通过RACE.PCR扩增获得凡纳滨对虾HSPl0基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并通过荧光定量PCR分析HSPlO基因的组织表达及低温胁迫下表达量的变化。【结果】凡纳滨对虾HSPlO基因cDNA全长720bp,包含306bp的开放阅读框,编码102个氨基酸。以各物种的HSPIO蛋白序列构建系统进化树,能较好反映各物种间的进化关系。荧光定量PCR分析结果显示,凡纳滨对虾HSPIOmRNA在各组织中呈遍在表达
3、,其中以肌肉中的表达量最高。低温表达谱分析结果显示,凡纳滨对虾HSPIOmRNA在低温处理凡纳滨对虾的各组织中均呈下调表达,当处理温度降至13*C,其在肝胰腺中表达量降至最低。【结论】凡纳滨对虾HsPJ佣E结构和进化上较保守,其mRNA表达量在低温胁迫下呈下降趋势,可能在寒冷耐受过程中发挥负调控作用。关键词:凡纳滨对虾;热休克蛋白;HSPIO基因;低温;表达量;荧光定量PCR中图分类号:$945.46文献标志码:A文章编号:2095一1191(2013)05—0838—06SequenceofHSP
4、IOgeneinLitopenaeusvannmeianditslowtemperatureexpressionanalysisPENGJin—xia,WEIPin—yuan,YINQin,JIANGXiao—zhen,LIMing,CHENXiao-han+(GuangxiKeyLaboratoryofAquaticGeneticBreedingandHealthyAquaeuhure/GuangxiInstituteofFisheries,Nanning530021,China)Abstract
5、:【Objective]HSPl0genewasclonedandstudiedtoprovidereferencesforitsregulationfunctionincold—resis-tanceduration.【Method]ESTdataminingandRACE-PCRwereusedtogetthewholelengthcDNAofLvHSPl0,andbio—in—formationmethodswereappliedtoanalyzethecDNA.LvHSPIOmRNAexpr
6、essionindifferenttissuesundercoldstresswerestudiedusingreal-timePCR.【Result]TheLvHSPIOcDNAwas720bplongcontaininga306bpORFwhichencodeda102Aapeptide.PhylogenetictreebasedonLvHSPIOaminoacidsequencescouldreflecttheevolutionrelationsamongvariousvari—eties.R
7、eal-timePCRresultsshowedthatLvHSPIOmRNApreferablyexpressedinalltissuesandmainlyexpressedinmuscle.Accordingtotheresultsfromlow-temperatureexpressionprofilesanalysis.theLvHSPl0mRNAwasdownregulatedinaUtis—suesofLitopenaeusvannmei,andwhenthetemperaturedesc
8、endedto130C,itsexpressionwasthe10west.【Conclusion]LvH—SPl0inLitopenaeusvannmeiwasconservedingenestructureandevolutionrelationship,anditsmRNA,whichwasonthedownsideincoldstress,mightnegativelyregulateincoldtolerance.Keywords:Litopenaeusva
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