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《多重PCR方法对大肠杆菌的毒力基因分型与系统进化分类.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、现代食品科技ModernFoodScienceandTechnology2014,Vol.30,No.3多重PCR对大肠杆菌的毒力基因分型与系统进化分类的研究11231倪奕弘,陈沿廷,魏霜,JamesChin,吴希阳(1.暨南大学理工学院食品科学与工程系,广东广州510632)(2.汕头市出入境检验检疫局,广东汕头515041)(3.伊丽莎白麦克阿瑟农业学院,新南威尔士康登2570)摘要:本文对不同来源大肠杆菌的毒力基因分布情况进行调查及系统进化分类,探讨大肠杆菌的系统进化分类与毒力基因携带的关联。本研究针对引起人类和动物肠道内或肠
2、道外疾病的6种病原型大肠杆菌的47个毒力基因,采用多重PCR方法对38株大肠杆菌和4株志贺氏菌进行毒力基因的分布调查及系统进化分类。肠道致病大肠杆菌中携带其病原型标志毒力基因和多种肠外致病大肠杆菌的毒力基因;非致病性大肠杆菌也携带某些肠外致病大肠杆菌的毒力基因,但是两者都不含肠道致病大肠杆菌的毒力基因。对42株菌的系统进化分类结果表明,大多数肠外致病大肠菌株属于B2或D。肠道临床菌株中大部分被归为D(19.2%)、B1(50.0%)和A(30.8%),3株非致病性菌株DH5α,BL-21和XL-10属于A。大肠杆菌毒力基因的携带和系
3、统进化之间有很显著的联系,肠道内与肠道外的感染与不同的毒力基因相关联。关键词:多重PCR;大肠杆菌;系统进化分型;毒力基因文章篇号:1673-9078(2014)3-38-42MultiplexPCRAssaysforEscherichiacoliPhylogeneticAssignmentsandVirulenceGeneOwnership11231NIYi-hong,CHENYan-ting,WEIShuang,JamesChin,WUXi-yang(1.DepartmentofFoodScienceandEngineering
4、,JinanUniversity,Guangzhou510632,China)(2.ShantouEntry-exitInspectionandQuarantineBureau,Shantou515041,China)(3.ElizabethMacarthurAgricultureInstitute,NSWDepartmentofPrimaryIndustries,Camden,NSW2570,Australia)Abstract:Therelationshipbetweendifferentphylogroupsandvirule
5、ncegenesofE.colifromvariousoriginswereidentified.Forty-sevenvirulencegenes(VGs)markersfoundinsixpathotypesofE.coliknowntocauseintestinalandextra-intestinaldiseaseinhumansoranimalswereinvestigated.MultiplexPCRassayswereusedtoscreen42strainsincludingclinicalandcommensali
6、solatesforthesevirulencegenesandassignthestrainstophylogeneticgroup.ResultsshowedthatIPECisolatespossessedtypicalIPECgenesandsomeExPECgenes.Thenon-pathogenicstrainsalsopossessedExPECgenes.NoneoftheExPECornon-pathogenicisolatesharboredVGstypicalforIPEC.Thephylogeneticgr
7、oupingof42isolatesshowedthatmostoftheExPECstrainsbelongtogroupB2orD.MostoftheintestinalclinicalisolateswereconfinedtogroupsD(19.2%),B1(50.0%)andA(30.8%),Threenon-pathogenicstrains,DH5α,BL-21andXL-10,belongedtogroupA.Thisstudyindicatedthatthepresenceofvirulencegeneswere
8、closelyrelatedtophylogeneticgroupings.Keywords:multiplexPCR;Escherichiacoli;Phylogeneticgrouping;virulencegene大肠埃希菌(E