7第七章卡方检验.ppt

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1、第七章检验(卡方检验)本章主要介绍卡方检验的基本概念、独立性检验方法、适合性检验方法在科研工作和渔业生产中,我们经常会碰到许多质量性状方面的资料,这些资料可以转化成率后使用t-test方法进行检验,但这仅限于一个样本率与总体率的比较、两个样本率间的比较除此之外,我们还可以用检验来完成检验工作特别当有多个样本进行比较时,必须用检验来完成第一节的概念在第四章中,我们讨论过分布有两个定义:定义一:定义二:前一个定义是针对数量性状资料的而后者主要是针对质量性状资料的在遗传学中,我们研究某一性状是否受一对等位基因的控制,该性状在后代的分离比例是否符合某种规律例1孟德尔的豌豆花试验(

2、红花705朵、白花224朵):这一分离是否符合他自己提出的3:1的分离比例的假设?如果这一3:1的理论比例是正确的,那么这一试验所出现的红花和白花的理论比例应当是:红花:696.75白花:232.25显然,实际出现的红花、白花的朵数与理论值之间有一定的差异(如何用t-test来完成这一检验?)连续进行多次试验,每一次的结果都不会相同,每一次的结果都不会刚好符合理论值可以这样设想:观察值与理论值之间的差距越小,表示试验结果与理论值越相符;反之,观察值与理论值之间的距离越大,表示试验结果与理论值越不符,当这一差值大到一定程度时,我们就可以认为豌豆花的颜色是不受一对等位基因控制

3、的,可能是另外一种遗传模式但如何来界定这种相符或不相符?当我们将这两个差值相加,我们会发现其和为0,可以说,任何类似的问题其结果都是0:(705-696.75)+(224-232.25)=0差值的平方和相加,其结果不会为0了,且由于平方,使得原来较大的差变得更大了,因而增大了分析问题的灵敏性但由于每次试验的样本量不会相等,因而缺乏可比性,以理论值为标准进行比较,问题就解决了上例中:红花:白花:两者之和:例2正常情况下,中国婴儿的性别比为:♂51:♀49即每出生100个女婴,就有103~105个男婴统计某地区连续3年的婴儿性别比,得:男婴4691人:女婴4159人,试问该地

4、区的新生儿性别比正常吗?我们用列表的方式检查之:婴儿性别实际值(O)理论值(E)O-E男婴46914513.5177.56.98女婴41594336.5-177.57.27合计88508850.0014.25显然,这一值较大,有可能这一地区的婴儿出生性别比不太正常(请用t-test进行检验,看这一性别比是否符合常规性别比)例3长翅灰身(LLGG)的果蝇与残翅黑檀体(llgg)果蝇交配,其后代F1全为长翅灰身,F1自群繁育,结果出现了4种表现型:长灰(1477)、长黑(493)、残灰(446)、残黑(143),现假定控制翅膀长度和身体颜色的两对基因是相互独立的,且都是显隐性

5、关系,则四种类型的果蝇其比例应当是9:3:3:1现需验证这次试验的结果是否符合这一分离比例1477+493+446+143=2559以上三个例子都要求我们判断观测值与理论值之间是否相符,而我们都可以得到一个值检验的一般步骤:首先作无效假设其次计算值最后根据值出现的概率判断无效假设是否成立自由度不同,分布是不同的分布的自由度仅与性状的类别有关,而与次数无关,例1中有两类花,因此其自由度为2-1=1例3中有4类果蝇,因此其自由度为4-1=3,等等当自由度为1时,检验应作校正,校正的检验公式记作质量性状的资料作检验,有两种方法,下面分别进行讨论第二节适合性检验适合性检验适用于某

6、一实际资料是否符合一理论值,因此适合性检验常用于遗传学研究、质量鉴定、规范化作业、一批数据是否符合某种理论分布,等我们以例3来说明适合性检验的一般步骤设立无效假设,果蝇的分类观测值与理论值相符两者不符计算值,前面已经得到df=4-1=3查值表,得接受无效假设,即本次试验中果蝇的这四种类型分离符合自由组合定律9:3:3:1例2的值需重新计算,因为性别比只有两类,因此其自由度为1,应作连续性校正连续性校正公式是:先作无效假设:该地男女婴性别比符合常规比例不符常规比例计算值查值表,得否定无效假设,接受备择假设,即该地区婴儿出生的性别比极显著偏离正常性别比,应查找原因(例1是否需

7、要作连续性校正?)上一章中关于鱼药厂销售治疗鱼烂鳃病新药的例题是否可以用检验?如果可以的话,是否需作连续性校正?(请同学们自行完成之)又例:将红色鲤鱼与瓦灰色鲤鱼进行杂交,其F1代全为瓦灰色,F1代自群繁育,得到的后代产生了分离:1738尾为红色鲤鱼,5504尾为瓦灰色鲤鱼试分析其遗传规律显然,从两代鲤鱼的体色变化,可以看出,红色为隐性,瓦灰色为显性,但是否是完全显隐性关系需做遗传学分析假定这是一对完全显隐性基因在起作用,红色和瓦灰色应当是1:3的关系设H0:鲤鱼体色分离比例为1:3VSHA:分离比例不符合1:3由于这里只有两

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