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时间:2019-08-13
《2019质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定实验报告》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定实验报告 质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定 一、实验目的 1.学习并掌握用碱裂解法提取质粒DNA的方法;2.学习并掌握了解质粒酶切鉴定的方法; 3.学习并掌握紫外吸收检测DNA浓度和纯度的原理和方法;4.学习并掌握PCR基因扩增的实验原理和操作方法;5.学习并掌握水平式琼脂糖凝胶电泳的原理和使用方法。 二、实验原理 (多聚酶链式反应) 在DNA聚合酶催化下,可以DNA为模板,以特定引物为延伸起点,以dNTP为原料,通过变性、退火、延伸等步骤,在
2、体外复制DNA,使目的DNA按2n方式呈指数形式扩增。 PCR一次循环的具体反应步骤为: A.变性:加热反应系统至95℃,使模板DNA在高温下完全变性,双链解链。B.退火:逐渐降低溶液温度,使合成引物在低温,与模板DNA互补退火形成部分双链。 C.延伸:溶液反应温度升至中温72℃,在Taq酶作用下,以dNTP为原料,引物为复制起点,模板DNA的一条单链在解链和退火之后延伸为一条双链。 2.质粒DNA的提取与制备(1).碱裂解法: 染色体DNA与质粒DNA的变性与复性存在差异:A.高碱性条件下,染
3、色体DNA和质粒DNA均变性; B.当以高盐缓冲液调节其pH值至中性时,变性的质粒DNA复性并保存在溶液中,染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,可通过离心形成沉沉淀去除。(2).离心层析柱: A.硅基质膜在高盐、低pH值状态下可选择性地结合溶液中的质粒DNA,而不吸附溶液中的蛋白质和多糖等物质; B.通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除; C.低盐,高pH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。3.质粒DNA的定量分析: A.物质在光的照射下会产生对光的吸收效应,且其对光的
4、吸收是具有选择性;B.各种不同的物质都具有其各自的吸收光谱:DNA分对波长260nm的紫外光有特异的吸收峰蛋白质对波长280nm的紫外光有特异的吸收峰碳水化合物对230nm的紫外光有特异的吸收峰 /A280及A260/A230的比值可以反应DNA的纯度;A260/A280= DNA纯净 A260/A280 含RNA杂质,用RNA酶去除。 4.质粒DNA的酶切鉴定: 限制性内切酶是DNA重组操作过程中所使用的基本工具。限制性内切酶能特异性地与一段被称为限制酶识别序列的特殊DNA序列结合,或是
5、与其附近的特异位点结合,并在结合位点切割双链DNA。 5.琼脂糖凝胶电泳: 琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度。 DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应:不同的DNA,分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带(迁移速度与分子量的对数值成反比关系). 三、材料与方法:实验材料: 仪器:PCR仪、台式离心机、微量加样枪、灭菌的薄壁离心管 材料:
6、菌液【大肠杆菌DH5a菌株(pMD19-T质粒,含目的片段-绿色荧光蛋白GFP)】、无菌去离子水、2×PremixTaq、引物2.质粒DNA的提取与制备 仪器:恒温培养箱、台式离心机、离心层析柱、Eppendorf管、微量加样枪、离心管材料:溶液P1、溶液P2(S2)、溶液P3、去蛋白液PE漂洗液WB、洗脱液EB仪器:比色杯、紫外分光光度计、微量加样枪材料:蒸馏水、质粒DNA4.质粒DNA的酶切鉴定 仪器:的EP管、微量加样枪 材料:无菌水、10×M酶切缓冲液BufR、质粒DNA、HindIII(1
7、5U/ul)、EcoRI(12U/ul)5.琼脂糖凝胶电泳 仪器:凝胶电泳系统、凝胶成像系统 材料:电泳指示剂、Gelview、TBE、琼脂糖、DNAMarker5000、电泳缓冲液 实验方法 准备目的DNA:菌液煮沸10min,冷冻,室温解冻后离心取上清液 2.质粒DNA的提取与制备 将扩增后的基因用微量加样枪加到电泳仪的凝胶孔中将装有PCR反应体系的PCR反应管放入PCR仪上进行如下操作:①94℃预变性5分钟后开始以下循环②循环为94℃——30秒,50℃——30秒,72℃——1分钟。循
8、环为30次③72℃5分钟④4℃保温 将PCR反应管置台式离心机中瞬时离心取mlPCR反应管一只,用微量加样枪按下述顺序分别加入:灭菌去离子水μl、2*Premixμl、引物1(10mol/L)1μl、引物2(10mol/L)1μl、菌液5μl 13000rpmx1min,弃上清取培养物加入Eppendorf管中 加入250μl溶液S1,吹打,使细菌沉淀分散,彻底悬浮加入250μl溶液S2,颠倒4~6次混匀,直到溶液变得清
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