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1、生物技术通报#技术与方法#BIOTECHNOLOGYBULLETIN2009年第9期蛋白质功能研究方法及技术1,211蒋英芝贺连华刘建军(1深圳市疾病预防控制中心,深圳518020;2湖南师范大学医学院,长沙410006)摘要:随着后基因时代的到来,蛋白质功能研究已经成为蛋白质组学研究的核心内容,是生物科学极具挑战的领域之一。近年来虽已有大量文章涉及某些蛋白质功能方面的研究,但对蛋白质功能研究方法方面进行系统综述的文章非常少,因此,从差异蛋白的筛选鉴定、蛋白质相互作用、蛋白质亚细胞定位、蛋白质表达改变的分子遗传学手段(如RNAi)、生物信息学等方面对目前蛋
2、白质功能研究方法和技术及其最新研究进展进行综述,研究者可根据不同的蛋白和实验需要选择适宜的方法。关键词:蛋白质功能蛋白质组学亚细胞定位蛋白质相互作用RNA干扰TheMethodsandTechnologiesforProteinFunctionStudy1,211JiangYingzhiHeLianhuaLiuJianjun12(ShenzhenCenterforDiseaseControlandPrevention,Shenzhen518020;TheMedicalCollegeofHunanNormalUniversity,Changsha410006
3、)Abstrac:tWiththepost2genomeeracscoming,theproteinfunctionstudyhasbecomethecoreofproteomics,andisoneofthemostchallengingissuesinlifescience.Althoughtherehavebeenalotofresearchesinvolvingproteinscfunction,thereviewsofmeth2odsandtechnologiesforproteinfunctionstudyareextremelyscarce.
4、Inthisreview,thecurrentmethods/technologiesanddevelopmentsofproteinfunctionstudywerediscussed,includingscreeningandidentifyingdifferentialproteins,protein2proteininteractions,proteinsubcellularlocalization,themoleculargeneticaltoolsinproteinexpressionchanges(suchasRNAi),andbio2inf
5、ormatics.There2searcherscouldchoosethesuitablemethodsandtechnologiesaccordingtothestudiedproteinsandtheexperimentdemands.Keywords:ProteinfunctionProteomeSubcellularlocalizationProtein2proteininteractionsRNAinterference蛋白质是生命的物质基础,是生命活动的最终sisofgeneexpression,SAGE)、DNA芯片等技术从基控制者和直接执
6、行者,它参与生物体内几乎所有的因水平上阐述生命活动规律,其前提是细胞中mR2生命活动过程,如生长、发育、遗传、代谢、应激、能量NA的水平反映了蛋白质表达的水平,但事实并非转换、信号传导等。100多年来,特别是20世纪生如此。从DNA到蛋白质,存在3个层次的调控,即物化学和分子生物学技术的蓬勃发展,如氨基酸序转录水平调控(transcriptionalcontrol),翻译水平调列测定、多肽合成技术、X射线衍射技术、电子显微控(translationalcontrol),翻译后水平调控(post2镜技术等,使人们认识到,蛋白质是一类结构和功能translat
7、ionalcontrol)。从mRNA角度考虑,实际上仅高度多样,并能对环境各种刺激做出自发响应的、复包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达[1,2]杂而神奇的/网络生命大分子0。水平。蛋白质作为生命活动的最终体现者,有其自随着后基因组时代(post2genomeera)的到来,身固有的特点,如蛋白质复杂的翻译后修饰、构象变科学家们的研究重心已经从解释生命的所有遗传信化、亚细胞定位或迁移、蛋白质间相互作用等,这些息转移到在整体水平上对生物功能的研究。采用差都无法在基因水平上找到答案。因此,要想真正揭异显示反转录PCR、基因表达系列分析(seriala
8、naly2开生命现象的奥秘,必须进行蛋白质水平的功能收稿日期:20
