差异蛋白质组学研究技术新进展

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1、万方数据hup：／／www．hxtb．org化学通报2005年第6期差异蛋白质组学研究技术新进展孙薇贺福初。(军事医学科学院放射医学研究所北京100850)·40l·摘要随着多项基因组计划的完成，人们越来越倾向于借助蛋白质组学手段在整体水平研究复杂蛋白质样品。差异蛋白质组学比较不同生物体在不同时刻，状态下蛋白质表达的变化，已广泛应用于各种研究。相关技术的建立成为蛋白质组学的一个核心技术问题。不同方法对蛋白质差异分析的能力和原理不同，可分为提供相对含量信息的定量差异分析技术和提供有，无信息的定性差异分析技术。此外，还有专门技术用于蛋白质修饰的差异分析。

2、多种技术手段的结合应用以及自动化、高通量分析已成为趋势，修饰研究成为新的研究热点，这些均将促进相关技术的进一步发展。本文介绍了差异蛋白组学研究技术及其进展。关键词蛋白质组学差异技术，AdvancesinDifferentialProteomicsTechniquesSunWei，HeFuchu’(LaboratoryofSystemsBiology，BeijingInstituteofRadiationMedicine，Beijing100850)AlmractRecentinterestinproteomicshasbeenfueledbythec

3、ompletionofmultiplegenomeprojectsandignitedbythecommonneedofbiologiststorapidlyandcomprehensivelyevaluatecomplexsamplesofproteinsona洲level．Differentialproteomics，focusingonthechangesofproteinexpressionsofdifferentcells／tissuesunderdifferentconditions，hasbeenappliedtOmanyresearc

4、hfields．Theestablishmentofdifferentialproteomicstechniquesstandsonthecentralstageinproteomicsanalysis．Everydifferentialproteomicstechniquehasitsown#ncipleandabilityfordifferentialanalysis，suchasquantitativedifferentialproteomicstechniqueswhichmakerelativequantitationavailablean

5、dqualitativedifferentialproteomicstechniqueswhichc帆onlygiveall／noneinformation．Modificationofdifferentialproteomicstechniqueshaveformedanotherbranch．Thetrendofcombinationofmultipletechniques，automation，high-throughputandtheneedofmodificationanalysiswillsurgetheadvancementofrele

6、vanttechniques．Inthispaper，thedifferentialproteomicstechniquesandtheiradvanceswereintroduced．KeywordsProteomics，Differential，Technique随着蛋白质组学研究的兴起，蛋白质的定性分析技术如蛋白质测序、肽质量指纹谱(peptidemassfingerprint，PMF)测定、序列标签以及相对分子量精确测定等已基本成熟，人们更关注蛋白质的定量表达分析，并将其应用于各类受关注的生命科学研究领域中。孙薇女，27岁，博士生，现从事疾病

7、蛋白质组学研究。联系人，中国科学院院士，E．mail：hdc@nic．bmi．aC．cn2004-11．08收稿，2005．-01．24接受万方数据·402·化学通报2005年第6期http：Ilwww．1lxtb．oIg蛋白质组表达差异分析的主要问题是如何合理比较蛋白质组之间的差异，即如何分析不同细胞，组织在不同时刻／状态下各种蛋白表达的相对丰度。因此建立可靠的蛋白质表达水平差异分析技术十分重要，是蛋白质组分析的一个核心技术问题。不同技术方法对蛋白表达水平差异分析的能力和原理是不同的0按照分析能力不同可分为提供相对含量信息的定量差异分析技术和提供有

8、／无信息的定性差异分析技术。此外，还有专门的技术用于蛋白修饰的差异分析。1定量差异分析技术定量差异分析技术可