人结肠癌组织的差异蛋白质组学研究

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1、中图分类号&匝:三±萝UDC斩。硕士学位论文学校代码?o冯密级盆丑人结肠癌组织的差异蛋白质组学研究TheDifferentialProteomicsStudyofHumanColonCancer作者姓名:学科专业:研究方向:学院(系所):指导教师:李园园病理学与病理生理学结肠癌的蛋白质组学研究肿瘤研究所陈主初教授中南大学二0一三年五月答辩委员会主席原创性声明本人声明,所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了论文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,

2、也不包含为获得中南大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在论文中作了明确的说明。作者签名:幽学位论文版权使用授权书本人了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留学位论文并根据国家或湖南省有关部门规定送交学位论文,允许学位论文被查阅和借阅;学校可以公布学位论文的全部或部分内容,可以采用复印、缩印或其它手段保存学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》,并通过网络向社会公众提供信息服务。肥7/l∥日期:丝芝年』月笪日本论文得到以

3、下基金的资助:国家重点基础研究发展计划(2011CB910700实体肿瘤的微环境蛋白质组研究)硕士学位论文中文摘要人结肠癌组织的差异蛋白质组学研究摘要背景:结肠癌是目前世界上常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率都位居恶性肿瘤前列。结肠癌的确切发病机制尚未完全阐明。应用蛋白质组学技术研究结肠癌的发生及发展过程,阐明其蛋白质种类及表达情况,可能会识别癌变相关的蛋白质,探讨其癌变的发病机制,为鉴定结肠癌癌变相关蛋白鉴定基础,尤其是寻找阻断癌变的靶蛋白,对于提高结肠癌的早期诊断和疗效,改善预后具有重要意义。方法:首先采用激光捕获显微

4、切割(1asercapturemicrodissection,LCM)技术纯化正常结肠组织和结肠癌组织,然后用同位素标记相对和绝对定量(iTIi,AQ)技术结合二维液相色谱串联质谱(2DLC.MS肌S)技术分离和鉴定人癌旁正常结肠组织与人结肠癌组织的差异表达蛋白质。采用KEGG通路分析差异蛋白质参与的信号通路以及生物学过程,采用(protein-proteininteraction,PPI)分析差异蛋白质的相互作用网络。WesternBlot和免疫组织化学染色方法验证差异蛋白质HSPDl、DCN和S100A9在结肠癌与正常结

5、肠组织中的表达水平。结果:(1)建立了结肠癌和正常结肠的差异蛋白表达谱,识别并鉴定188个差异表达的蛋白质点,其中在结肠癌上调的蛋白77个,下调的蛋白111个。(2)KEGG通路分析显示:这些蛋白质涉及与肿瘤相关的一些生物学过程,如TGF.beta信号通路、细胞生长与死硕士学位论文中文摘要亡、信号传导、细胞周期以及凋亡等。(3)PPl分析结果显示:差异蛋白形成相互作用网络图,其中HSPDl居于网络的重要节点,并与DCN、S100A9等蛋白相互作用。(4)WesternBlot结果验证HSPDl和$100A9在结肠癌中表达上调

6、,DCN在结肠癌表达水平下调;免疫组织化学染色验证HSPDl和$100A9在结肠癌中表达上调,DCN在结肠癌表达水平下调。结论:本次研究采用的是基于激光捕获显微切割的蛋白质组学技术筛选并鉴定了结肠癌组织与正常结肠组织共188个差异表达的蛋白,其中在结肠癌中上调的77个,下调的111个。其中,HSPDl、DCN以及S100A9在KEGG通路分析和PPI蛋白质相互作用分析中参与与癌症相关的生物学作用,为进一步研究结肠癌发病的分子机制提供实验依据。关键词:结肠癌,激光捕获显微切割,定量蛋白质组学,iTRAQ分类号:R735.3+5

7、II硕士学位论文英文摘要TheDifferentialProteomicsStudyofHumanColonCancerABSTRACTBackground:Coloncarcinomaisoneofthemostcommonmalignantcancerintheworld,theincidenceandmortalityofthecoloncancerarealsointhefrontrankoftheworld.Thepathogenesisofthecoloncancerhasnotinterpretcomplete

8、ly.Proteomicsisawelltechnologytoresearchthecoloncancer’Scarcinogenesisandgrowprocess,andmayidentificationtheproteinrelatedwiththecarcinogenesis,S

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