家蚕核型多角体病毒与家蚕抗病毒相关的蛋白质组分析

家蚕核型多角体病毒与家蚕抗病毒相关的蛋白质组分析

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1、江苏大学博士学位论文家蚕核型多角体病毒与家蚕抗病毒相关的蛋白质组分析姓名:刘晓勇申请学位级别:博士专业:食品科学指导教师:陈克平;姚勤20090606江苏大学博士学位论文:家蚕核型多角体病毒与家蚕抗病毒相关的蛋白质组分析葡萄糖苷酶可能会干扰细胞膜上的GP64蛋白的N连接聚糖,从而阻止了启动二次感染的一个关键蛋白的功能,进而减少了产生有感染力病毒粒子。在脂肪体组织中鉴定了4种蛋白,其中2种可能与能量代谢有关,其中l号蛋白与磷酸甘油激酶(PGK)在序列上高度相似,2号蛋白是家蚕精氨酸激酶(AK)。第4号蛋白可能和整合酶

2、的功能相似,第3号蛋白未能鉴定。为了从分子水平上评估我们构建的近等基因系的可靠性,尤其是对其与感性的轮回亲本之间遗传背景的相似性进行了评估。在本研究中,我们对随机多态性DNA和双向电泳的一些结果进行了分析,证明其相似性虽比理论的要低,但这个模型方法对研究抗性仍然是有价值的,对研究家蚕其它的差异基因也是有借鉴作用的。我们还利用收集的家蚕EST数据经转换格式后形成MASCOT软件识别的数据库,每个EST经6种阅读框翻译,然后通过MASCOT软件对质谱数据进行分析。还举例说明这种方法能鉴定那些在目前的蛋白序列数据库中没有

3、的多肽。这对一些蛋白数据不够充分的物种蛋白鉴定也有参考价值。关键词:家蚕,家蚕核型多角体病毒,包埋型衍生病毒,随机扩增多态性DNA,二维电泳,质谱,近等基因系,表达序列标签ⅡABSTRACTBmNPV(BombyxmoriL.nucleopolyhedrovirus)isakeypathogenytosilkwormwithhighlyinfective.Andthereciprocitybetweenvirusandhostisanimportantissuewhichwaspaidmanyattentionsb

4、yresearchersallthetime.Inthispaper,westuiedtheproteincompositionofbaculovirusODVonproteomiclevel,andtherelatedproteinsofresistancetoinfectioninhostthroughconstructednear.isogenicline.wishtofindsomeproteinswhicharerelatedtoresistanceorsusceptibilityofsilkworm。胎

5、alsoscreenedthemolecularmakersthatrelatedtoresistancgonDNAlevel.Inaddition.weevaluatedtheconstructednear-isogeniclinefromdifferentpointsofview,andanalyzedthemethodthatidentifiedmassspectrometryresultsusingESTdatabase.Theresultsareshownasfollows.眙obtainedtheocc

6、lusion.derivedvirus(ODV)virionofBombyxmorinucleopolyhedrovirus(BmNPV)bysucrosedensitygradientcentrifugation,andusedtechniquesofSDS.PAGE.2.DEandMStoidentifytheproteinspresentwithinorassociatedwithODVvirionforthefirsttime.19proteins,including15majorproteinsofthe

7、virionencodedbyBmNPV,Polyhedrin,P78/83,Orf40,Orf54,GP41/P40,P95,VP39,P25,ODV-EC43,Off94,Orf109,P74,P49,ODVE56andPTErespectively,and4proteinsofsilkworm。heatshockcognateprotein,heatshockproteinhsp21.4,glutathioneS.transferase2andcyclophiliIlA,wereidentifiedwithc

8、onfidence.TwOBmNPVproteins.off40andPTP,thosedidn’tdetectedascomponentsofoDVpreviously,wereidentifiedinthisstudy.Andweproposeahypothesisthatthosehost.derivedproteinsmaybeimportantfo

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