马圆形线虫和马尖尾线虫线粒体全基因组扩增与序列分析

《马圆形线虫和马尖尾线虫线粒体全基因组扩增与序列分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、Universitycode：10223Classifiedcode：S855.9Graduatenumber：XS1233083Confidentialdegree：PublicHeilongjiangBayiAgriculturalUniversityMasterDissertationResearchoncompletemitochondrialgenomeandmolecularphylogenyofStrongylusequinusandOxyurisequiPostgraduate：XuWenwenSupervisor：ProfessorWangChun-Ren

2、Major：VeterinaryPreventionScienceMolecularparasitology&ParasitosisResearchdirection：ControlCollege：GraduateCollegeDaqingChinaJune,2015摘要马圆形线虫（Strongylusequinus）是寄生于马、骡、驴等马属动物结肠和盲肠内的一种线虫，引起贫血、腹泻、水肿等症状。马尖尾线虫(Oxyurisequi)俗称马蛲虫，也寄生于马、驴等马属动物的结肠和盲肠内，引起胃肠道障碍、营养不良、消瘦等症状。感染两种线虫均能导致马属动物生产性能的下降，且广泛流行

3、于世界各地，给畜牧业生产造成严重的经济损失。目前对马圆形线虫和马尖尾线虫的研究仅限于虫体形态学、流行病学、病原诊断及综合防治等方面，而关于两者的线粒体基因组序列分析及进化的研究还未见报道。本研究首先从自然感染的马大肠内采集马圆形线虫和马尖尾线虫虫体，经形态学鉴定后，采用步移PCR方法扩增马圆形线虫和马尖尾线虫线粒体全基因组，同时进行序列分析。结果表明，获得的马圆形线虫和马尖尾线虫线粒体基因组全长分别为14545bp和13641bp，均含有12个蛋白编码基因（protein-codinggene）、2个rRNA基因（rRNAgene）、22个tRNA基因以及分别为3个（马圆形

4、线虫）和1个（马尖尾线虫）非编码区（noncodingregion）。马圆形线虫线粒体全基因组核苷酸组成为：A=31.06%,G=15.72%,C=6.18%,T=47.07%,A+T含量为78.10%。马尖尾线虫线粒体全基因组核苷酸组成为：A=18.89%,G=26.31%,C=5.87%,T=48.93%,A+T含量为67.82%。马圆形线虫的线粒体基因组碱基组成明显偏好碱基T和A，而马尖尾线虫明显偏好碱基T和G，二者的线粒体全基因组中碱基T的含量最高，碱基C的含量最低。马圆形线虫的基因排列顺序属GA3型，马尖尾线虫的基因排列顺序属GA13型。其次，利用线粒体基因组12

5、个蛋白质编码基因的氨基酸序列构建进化系统发生树，探讨马圆形线虫和马尖尾线虫在线虫中的分类地位。以串联的12个蛋白质编码基因氨基酸序列为基因标记，采MP、ML及BI法分别对两种虫体构建系统发生树。马圆形线虫的进化树形成两个大的分支，寄生于消化系统的线虫为一个分支，寄生于呼吸系统的为另一分支；马圆形线虫位于消化系统的分支上，与普通圆线虫的亲缘关系最近。马尖尾线虫进化树也形成两个大的分支，丝虫目为一个分支，蛔目、圆形目和尖尾目为另一分支，且各目又单独形成一个小的分支，马尖尾线虫位于尖尾目的分支上，与Wellcomiasiamensis和蠕形住肠线虫有较近的亲缘关系。通过本研究，首

6、次获得了马圆形线虫和马尖尾线虫的线粒体全基因组序列，进一步丰富了寄生线虫的线粒体基因组库。同时，基于线粒体基因氨基酸序列构建的系统发生树，-I-从分子水平上探讨马圆形线虫和马尖尾线虫在线虫中的分类地位和进化关系。关键词，马圆形线虫；马尖尾线虫；线粒体全基因组；系统发生IIAbstractStrongylusequinusisthemostcommonblood-feedingnematodesinthececaandcolonofequus(suchashorses,mulesanddonkey),whichmayleadtoanemia,diarrheaandedema.

7、Oxyurisequiisknownaspinworm,whichalsoinhabitlargeintestinalofequus,whichmaycauserapidweightloss,malnutritionandgastrointestinaldysfunction.S.equinusandO.equinematodescandecreaseproductionperformanceinequus,andthetwonematodediseasesareworldwidedistribution,sowh