两种水稻螟虫线粒体全基因组序列分析

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1、、??一??争-?gr.'?£r.;..%ij心>沒.7麻牌誠繁豕;^|重丽;圃陋?長妻續击学位冷权胃?―'.—乃‘‘4^於U著:細細則线祕全細酪…‘、。V户:气文;V、、:'曹爽爽一.i於私;若>:l:i户^jif'-一"—巧导教师巧墓卢-/:化丰州教授,扬州大学,江苏扬州,^250巧./iSi;植物保批申请学化级别i硕击学科专业名称.,论文提交日期:2015年5月论文答辩日期:2015年5月24曰\寶:.^碱、学位授予单位日期:、;扬州大学学位授予或一.

2、.?.答辩委员会主席:陈学新教授浙江大学策-三分庐—y义争':,C-':-.V乃於唉卢.分奏來>苦芝3^幾.、%皆、节/成.苗其心去户之;:;巧對气处;3篆就《y纖麵聲滅气1ANALYISISOFTWOCOMPLETEMITOCHONDRIALGENOMEOFRICESTEMBORERSBYCAO-ShuanShuanggADISSERTATIONSUBMITTEDINPARTALFULFILMENTOFTHEREQUIREMENTSFORTHEDEGREEOFMAS

3、TERWITHMAJORINPLANTPROTECTIONADVISOR-;PROFESSORP圧DDUYuZhou()YANGZHOUUNIVESITYYANGZHOU,JIANGSU,CHINAMAY,20153本研究受国家重点基碱研究发展规划(973计划)资助2012CB114100和2013CB127604-4)。(ThisworkissuortedbtheNationalBasicResearchppyProgram(973Program)ofChina(2

4、012CB114100and2013CB127604-4.)I病要.大頓(泌说於?ms)、二化換(CTi'to琴戶M幻化)、兰化頓(乃7/70叩之幻加ce灯w/as)’和台湾稻喚(CMoflwZc加W)是众所周知的鱗翅目喚蛾总科水稻害虫,广泛分布于中国主要一。、水稻种植区的重要害虫近年来,由于气候水稻品种W及种植制度的变化,在些地区为害日趋严重。本文对H化螺和台湾稻螺线粒体全基因组进行测序及序列特征分析,并比较分析了4种水稻钻化性害虫的线粒体全基因组的异同。同时8种,比较分析了換蛾总科昆虫线粒体基因狙的特征。主要研究结果

5、如下;1.水稻H化嗔线粒体全基因组为15,223bp,包含巧个典型的线粒体基因(13个蛋白一质编码基因、22个转运RNA基因和2个核糖体RNA基因)和个大的非编码区(又称控制区)。除了COX/WCGA为起始密码子,其余12个蛋白质编码基因均WATN作为起始密码子,除了妨WTAG为终止密码子,其余WTAA、TA和T作为终止密码子。22个tRNA基因都能形成典型的H叶草结构,只有托n庇心GW基因缺失DHU臂。16S的)二级结构包含五个部分(标记为I,II,IV,V和VI)共49个环型结构缺失区域III,12S由3个结构域组成

6、共33个环型结构。此外,H化換线粒体基因组的控制区中有2个|i|'2TATA-1。茎环结构,个微卫星,1T结构和4个9b()i2和()9个p〇的重复单元!yp2.台湾稻頓的全长为5367b371,个编码基因的相对位置及转录方向与H化暢的顺序,p^^th一致^AGO,tRNA基因的二级结构中缺失DHU臂,其余tRNA基因的二级结构均为典型的H叶草结构,2个核糖体RNA的二级结构均和其它麟翅目昆虫的相似。此外,控制区中有五个结构域一一,包含个12bp重复单元和个27bp的重复单元,两个TA微卫星结构()n一和个poyT结构。^一"

7、3.草膜科昆虫有个叮nATnG序列的保守区位于加7和coxi基因之间的间隔区""一""一INGS2区域的序列为TAG。段保守的序列ATACTAAA,大赎这草換科屋虫中存在位于拍(f/CiV)和nfl说间的间隔区IN说4。此外,控制区中有五个重复单元,两个TAT一TAol,而二化螺中却微卫星结构和p结构,但大換中只有个微卫星结构()?y()?没有一,大喚形成个茎环结构,但二化頓和台湾稻換中却没有。除了米頓和稻纵卷叶惧,其它換蛾总科昆虫线粒体基因组中碱基A的含量高于T,,异亮氨酸,天冬酌胺亮氨酸和苯丙氨酸是四种昆虫中普遍存在的氨基酸,都

8、使用双重简并密码子。位于化和na泌之间的间隔区I

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