非伤寒沙门氏菌临床株毒力基因初步分析

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1、分类号:R378.2+2学校代码:10062密级:学号:2012602340硕士学位论文MASTER’SDISSERTATION论文题目:非伤寒沙门氏菌临床株毒力基因初步分析TITLEVirulence-associatedgenesofNontyphoidalSalmonellaisolatedfrompatientswithdiarrhea一级学科:临床医学二级学科:内科学传染病论文作者:张成龙指导教师:王玉宝天津医科大学研究生院二〇一五年五月分类号:R378.2+2学校代码:10062密级:学号:20126023

2、40学位类别:科学学位√专业学位学科门类:医学硕士学位论文MASTER’SDISSERTATION论文题目:非伤寒沙门氏菌临床株毒力基因初步分析TITLEVirulence-associatedgenesofNontyphoidalSalmonellaisolatedfrompatientswithdiarrhea一级学科:临床医学二级学科:内科学传染病论文作者:张成龙指导教师:王玉宝天津医科大学研究生院学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交的论文是我个人在导师指导下独立进行研究工作取得的研究成果。除了文中特别加以

3、标注引用的内容和致谢的地方外,论文中不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。学位论文作者签名:日期:2015年6月3日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解天津医科大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,并采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编以供查阅和借阅。同意学校向国家有关部门或机构送交论文,并编入有关数据库。保密,在年解密后适用本授权书。本论文属于不保密。(请

4、在相对应的方框内打“√”)学位论文作者签名:日期:2015年6月3日导师签名:日期:2015年6月3日天津医科大学硕士学位论文中文摘要目的:采用PCR扩增和DNA序列分析技术,检测急性腹泻患者分离的非伤寒沙门氏菌(NTS)毒力基因携带情况与特点,探讨感染人体的NTS菌株血清型、分子分型、耐药表型与毒力基因携带的关系,为预防与控制NTS感染提供依据。方法:1、毒力基因检测:实验菌株为2012年~2013年分离自天津医科大学第二医院肠道门诊急性腹泻患者粪便标本的45株NTS,包括12个血清型、23个PFGE型和13个MLS

5、T型;以毒力岛SPI1~5基因sitC、hilA、sseL、sifA、mgtC、siiE、sopB毒性质粒基因prot6E、pefA、spvB和DNA毒素基因cdtB和调控基因phoP为目的基因,进行PCR扩增,并对cdtB阳性的菌株cdtB、pltA、pltB基因的全长进行扩增。2、PCR产物序列分析:从每个目的基因的PCR扩增阳性产物中随机挑选1株进行测序分析;对cdtB及其相关基因pltA和pltB进行全长扩增测序,用BLAST和ClustalX分析其DNA序列以及推导出的氨基酸序列与GenBank中代表性菌株序

6、列的相似性。3、毒力基因携带与抗菌药物敏感性统计分析:使用SPSS20.0软件进行统计学分析。毒力基因携带与对抗菌药物的敏感性用Fisher精确计算进行统计,P<0.05视为有统计学差异。结果:1、45株NTS毒力基因检出率依次为:sitC、hilA、mgtC、siiE、sopB、phoP100%,sseL、sifA97.78%,prot6E31.11%,pefA、spvB37.78%,cdtB2.22%。与GenBank中对应的参考序列相似性分别是sitC98%、hilA98%、siiE99%、spvBI天津医科大学

7、硕士学位论文100%、prot6E100%、sifA99%、mgtC100%、sopB99%、sseL100%、pefA99%、phoP100%、cdtB99%。2、毒力岛基因:45株NTS全部检测到了sitC、hilA、mgtC、siiE、sopB;除了菌株406,其余44株都检测到sifA基因;除了菌株25,其余44株都检测到sseL基因。3、毒性质粒基因:全部14株肠炎血清型沙门氏菌,无论PT型如何,都检测到了位于质粒上的毒力基因prot6E、spvB、pefA;全部9株鼠伤寒血清型沙门氏菌中,3株ST19型检测

8、到spvB和pefA,prot6E则阴性,它们的PT型分别为PT04和PT20,而另外6株ST34型都没有得到以上3种基因阳性扩增产物;其他血清型菌株也均未得到这3种基因阳性扩增产物。4、cdtB基因:有1株格兰扁血清型沙门氏菌检测到了cdtB基因,测序结果显示cdtB长819bp,其相关基因pltA长729bp,pltB长414

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