细毛羊毛性状候选基因遗传效应的研究

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时间:2019-03-15

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1、.分类号S813学校码10758:1235020270密级::公开学号,硕:t学備文细毛羊毛性状候选基因逸传效应的研究纷udonGe凸eticEffectsofCaiMlida化Gene0田WoolTTraits化yFineWoolSheep'■VI研究生姓葦柏妍导师姓矣及职称黄锡震教授合作导师姓葦及职称田可川研究员 ̄学位口类缓别农学硕去专业名称动物遗备^与繁殖研究方向分子遺传学所在学院动物科学学院新疆?乌鲁木齐二〇一户五年六月、-,4r'

2、.,.■‘,■y..;;.I‘'.,■心‘I,.?’■*■,r.;1、独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得新疆农业大"学或其他教育单位的学位或证书而使用过的材料-。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。/^研究生签名;俗户时间;^。公年月^日关于学位论文使用授权的说明本人完全了解新疆农业

3、大学有关保留、使用学位论文的规定,即:新疆农业大学有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子文挡,可1^采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文,允许论文入被查阅和借阅。本人授权新疆农业大学将学位论文的全部或部分内容编有关数据库进行检索,解可公布(包括刊登)论文的全部或部分内容。C保密的学位论文在密后应遵守此协议)"/研巧生签名;时间/月八日导师签名:时间:年6月逆^杉々戶^本研究由以下项目资助国家自然科学基金项目(项目编号:31360543)“十二五”自治区重大专项(项目编号:201230116-6)现代农业产业技

4、术体系建设专项(项目编号:CARS-40)细毛羊毛性状候选基因遗传效应的研究摘要本研究以细毛羊754个个体为材料,采用DNA池和第二代重测序技术相结合,测序筛选候选基因FZD3、SFRP4、Notch1和PTPN13的SNPs,同时筛选出可能与毛性状显著相关的SNPs,运用MassArray技术对显著的2个SNPs以及候选基因的9个SNPs进行基因型分型,采用SAS9.1最小二乘方法分析11个SNPs与毛性状关联性,以期筛选与细毛羊经济性状相关的分子标记,为今后培育细毛羊新品种提供试验依据。主要研究结果如下:1.利用DNA池检测与细毛羊毛性状相关SNPs利用重测序技

5、术对两个极细和极粗的DNA池中筛选出与毛性状相关的SNPs:T19381438G和G19381838T,这两个位点距离ACAN基因120kb处;FZD3基因筛选出32个非同义突变位点,4个同义突变位点,1个密码终止子;Notch1基因筛选出3个非同义突变位点,9个同义突变位点;PTPN13基因筛选出9个非同义突变位点,19个同义突变位点;而SFRP4在编码区只发现1个同义突变位点。2.连锁不平衡分析以及单倍型分析2ACAN基因的两个突变位点:T19381438G和G19381838T处于强连锁不平衡状态,D′和r值分别为:1和1;基因PTPN13中T10127526

6、1C和A101276228C突变位点,T101275261C和G101300776突变位点2处于连锁不平衡状态,D′和r值分别为:1和0.326,1和0.469。3.候选基因的多态性检测及其与细毛羊毛性状的关联分析运用SAS9.1对11个SNPs与毛性状的GLM分析,结果显示,FZD3基因的A101762198T突变位点与剪毛量显著相关(P<0.05),Notch1基因的A2886871G突变位点跟细毛羊的鉴定时体重以及剪毛后体重分别呈显著相关(P<0.05)和极显著相关(P<0.01),A2899358G突变位点跟纤维离散、变异系数和鉴定时体重呈显著相关(P<0.

7、05);PTPN13基因的A101281906C和A101279366G突变位点跟剪毛后体重分别呈显著相关(P<0.05)和极显著相关(P<0.01),A101276228C突变位点和鉴定时体重呈显著相关(P<0.05)。关键词:遗传效应;毛性状;候选基因;DNA池;重测序;MassArray;细毛羊IStudyonGeneticEffectsofCandidateGeneonWoolTraitsinFineWoolSheepAbstractInthisstudy,used754finewoolsheepindividualsasresearchmaterial

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