中国荷斯坦牛产奶性状候选基因的遗传效应分析

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1、．分类号：Ｓ８２３９：学校代码１０７５８密级：公开学号：１２３５０２０２７３‘糸ｆ乂參－义硕壬学位论文？，■＇■二中国荷斯坦牛产奶性状候选基因的逸传效应分析ＧｅｎｅｔｉｃＥ化ｃｔ乂ｎａｌｙｓｉｓｏｆＣａｎ化ｄａｔｅＧｅｎｅｏｆＭＵｋＰｒｏｄｕｃｔｉｏｎＴｒａｉｔｓｉｎＣｈｉｎｅｓｅＨｏｌｓｔｅｉｎＣａｔｔｌｅ研究生姓名李金霞导师姓杂及职称黄巧霞教授合作导师姓名及职称学位口类级别农学硕去专业名称动物遣传育种与繁

2、殖研究方向分子數责遺传学所在学院动物科学学化新疆？乌鲁木齐二〇—五年六月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，论文中，除了文中特别加标注和致谢的地方外不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得新疆农业大学或其他教育单位的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均在论文中作了明确的说明并表示了谢意。Ｐ研究生签名时邮年巧日＾（＾关于学位论文使用授权的说明本人完全了解新疆农业大学有

3、关保留、使用学位论文的规定，即；新疆农业大学有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子文档，可レッ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文，允许论文入被查阅和借阅。本人ｉ权新疆农业大学将学位论文的全部或部分内容编有关数据库进行检索，可公布（包括刊登）论文的全部或部分内容。（保密的学位论义在密后应遵守此协议）ｔ＾研巧生签名；时间／文年月曰遷參导师签名；时邮０年月曰化《方苗餐覆》本研究由以下项目资助新疆维吾尔自治区科技计划项目（项目编号：201230116-7）现代农业产业技术体

4、系建设子课题（项目编号：CARS-37）“十二五”国家科技支撑计划课题（项目编号：2012BAD12B09）新疆农业大学产学研联合培养研究生项目（项目编号：xjaucxy-yjs-20131075）中国荷斯坦牛产奶性状候选基因的遗传效应分析摘要本研究以新疆呼图壁种牛场、乌鲁木齐种牛场和天山畜牧工程有限公司荷斯坦牛群体为研究对象，利用2011-2014年间牛只DHI测定数据、生产性能测定记录和产犊记录，采用DNA混池全基因组重测序技术筛选SNPs和MassArray技术进行SNPs分型，运用SAS8.1软件进行产奶性状遗传效应

5、分析。旨在挖掘与中国荷斯坦牛产奶性状相关的分子标记并对已发现的最新报道的分子标记进行验证，为中国荷斯坦牛产奶性状的分子标记辅助选育提供理论依据。得到以下结果：1.通过DNA混池全基因组重测序技术得到大量的SNPs，通过对SNP位点的筛选并根据MassArray技术检测要求，最终选取6个SNPs进行下一步分型试验，6个SNPs均属于非同义变异，并属于首次发现的SNPs。2.使用MassArray技术对15个SNPs进行基因型分型（6个SNPs由DNA混池重测序获得，9个SNPs由文献报道获得），研究分型结果与产奶性状的遗传效应

6、。共发现G73896754A、C79894591T、C43045807T、C107216562T、A38899763G、T41947097G、A16234934G和A80965296G8个位点对产奶性状有显著影响，其中G73896754A对乳脂率有显著影响（P<0.05）；C79894591T、C107216562T、A38899763G和T41947097G对乳蛋白率有显著影响（P<0.05），T41947097G对乳蛋白率的影响极显著（P<0.01）；C43045807T对乳糖率有极显著影响（P=0.01）；A16234

7、934G对乳脂量、乳糖率和体细胞分均有显著影响（P<0.05）；A80965296G8对305d奶产量有显著影响（P<0.05）。3.采用Haploview软件对SNPs进行连锁及单倍型分析，共发现3个单倍型模块。A16234934G和C16233476T位点的单倍型对乳脂量有显著影响，对乳糖率有极显著影响；C79894591T和G73896754A位点的单倍型对乳脂率有显著影响；G98736141A和T98741711C位点的单倍型对乳糖率有显著影响。本研究就15个SNPs位点对新疆地区中国荷斯坦牛产奶性状遗传效应进行研究

8、，发现T41947097G、C43045807T位点和TTGG、CCGG和AACC单倍型可能对中国荷斯坦牛产奶性状有较大的遗传效应。进一步的研究需要扩大群体，对T41947097G、C43045807T位点和TTGG、CCGG和AACC单倍型对产奶性状遗传效应进行验证，以确定与产奶性状遗传