角蛋白及faim基因对细毛羊毛性状的遗传效应

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4、FAIM基因对细毛羊毛性状的遗传效应摘要本研究以中国美利奴羊（新疆型）为研究对象，应用DNA混池重测序和MassArray技术筛选角蛋白基因（KRT26、KAP16）和FAIM基因的SNP，并对SNP遗传效应进行分析。结果如下：1.利用DNA混池重测序技术对KRT26、KAP16和FAIM基因进行序列比对分析，共检测到29个SNPs，其中16个为同义突变，13个非同义突变。FAIM有2个外显子取区域，有2非个同义突变。KRT26有4个外显子区域，有2个非同义突变，6个同义突变。KAP16有4个外显子区域，有9个非同义突变，10个同义突变。按照分型技术的要求最

5、终筛选得到6个有用的SNPs，分别为C248582270T、C40544613G、C41006938T、A41009186G、T41006710C、A41007121C。C248582270T位点使外显子2的第83个氨基酸由甘氨酸（Gly）变为谷氨酸（Glu）；C40544613G和A41009186G位点使外显子1的第59个氨基酸和第69个氨基酸分别由甘氨酸（Gly）变为精氨酸（Arg）和缬氨酸（Val）变为丙氨酸（Ala）；C41006938T、T41006710C和A41007121C位点使外显子5的第375个、1451个和314个氨基酸分别由甘氨酸（

6、Gly）变为丝氨酸（Ser）、异亮氨酸（Ile）变为缬氨酸（Val）、半胱氨酸（Cys）变为甘氨酸（Gly）。2.应用MassArray技术，对KRT26、KAP16和FAIM基因的SNPs进行分型，并采用SAS8.1软件分析基因型跟毛性状的关系，结果得到：C41006938T位点对剪毛后体重有极显著的影响。A41009186G位点对弯曲数有显著的影响。T41006710C位点对纤维直径变异系数和鉴定时体重有显著的影响。KAP16基因的C41006938T位点，CC基因型的剪毛后体重显著低于CT和TT基因型。A41009186G位点，AA基因型的弯曲数显著高

7、于GA和GG基因型。A41006710C位点，CC基因型的纤维直径变异系数和鉴定时体重显著高于CT和TT基因型。3.利用Haploviewversion4.1软件对6个SNP进行连锁不平衡分析，其中4个SNP组成一个单倍型Block分别为C41006938T、A41009186G、T41006710C、A41007121C。T41006710C和C41006938T处于强连锁不平衡状态；T41006710C和A41009186G、C41006938T和A41009186G处于连锁不平衡状态。C41006938T与A41009186G位点单倍型的变异系数和剪毛

8、后体重显著差异于其他单倍型。关键词：细毛羊；毛性状；