广州地区育龄期女性阴道菌群多样性分析

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1、分类号密级UDC编号*似省似淨硕壬学位论文广州地区育龄期女性阴道菌群多样性分析-DiversitofvainalmicrobiomeonreproductiveaewomenygginGuangzhou吉勇导师姓名周宏伟教授专化名称劳动卫生与环境卫生学培养类型学术型论文提交日期2015年05月20日南方医科大学2(H2级硕击学位论文广州地区育龄期女性阴道菌群多样性分析Dva-iversityofinalmicrobiomeonrerodu

2、ctiveaewomengpginGuangzhou课题来源(31322003):国家自然科学基金优秀青年科学基金国家自然科学基金面上项目(312701152)学位申请人吉勇导师姓名周宏伟教授专业為称劳动卫生与环境卫生学培养类型学术型培养层次硕壬研究生所在学院公共卫生与热带医学学院答辩委员会主席邹飞教授答辩委员会委员钟梅教授马文军主任医师谢志教授刘木彪主任医师2015年05月20日广州硕去学位论文广州地区育龄期女性阴道菌群多样性分析研究生:吉勇指导老师:周宏伟教

3、授化巧炯安研究背景:阴道菌群与宿主形成互惠关系,是女性多层面抵御病原菌入侵的重要组成。部分,对机体的健康和疾病有着重大影响近年来16SrRNA基因测序方法的应用。,使我们对阴道菌群结构和组成的认识显著提高在无症状或者健康女性阴道内存在着几种微生物群,而其他的也由多种,多数W乳酸杆菌为主要优势菌大量的厌氧微生物组成。阴道pH值与阴道菌群相关,其可能指示了群落的表现,""低阳值(斗5)多被认为健康的同义词。对物种组成之间更深的认识需要、了解它们随着时间的推移或对机体环境改变如何响应,月经和诸如性交冲洗及其他行为习惯等人类

4、活动对阴道生态系统造成的动态变化,这也是对疾病诊断和评估风险的基础。基于阴道生态系统真正的功能而不只是其简单的组成,"""健康"一更好的理解其正常和,将有助于更明确的界定健康,进步提高疾病的诊断和开发更个性化的治疗方案,更好的促进健康和治疗疾病。基于细菌16SrRNA进行测序的第二代高通量测序技术,具有通量高,成本低廉的优点,获,能够显著改善传统微生物研究方法的不足得比较理想的微生物群落数据,为我们研究微生物生态学奠定了昆好的方法学基础。本课题组建立了基于Illumina双末端测序16SrRNA标签序列分析微生物群落的新方法,即

5、BIPES,并建立了新的序列聚类工具TSC,操作简便、可定量定性。QIIME可W高效低成本地分析微生物群落。2008年NationalInstitutesofHeal化NIH.57亿,美国国立卫生研究院(资助1,)美元投资人体微生物计划(HumanMicrobiomeProectHMP),j,建立并不断完善I摘要了微生物基因数据库,也不断揭示菌群与健康、疾病之间的关联。但是种族、地理、文化、行为等因素均可导致人体阴道菌群结构差异,而生活在中国广州地区育龄期非孕妇人群阴道菌群分布特征、女性性工作者阴道菌群分布特征

6、W及女性月经周期阴道菌群动态变化尚不明确。研究目的:一1、阐述中国广州地区育龄期般女性人群的阴道菌群特征及阴道化4.5和H>4.5中微生物群落的多样性,通过分析闲义5组和H>4.5组的(X、PppP多样性W及菌群构成,用LEfSe在线工具寻找两组中有统汁学差异的taxa,进一一步展示般女性阴道菌群多样性。2、揭示特殊女性群体性工作者阴道菌群菌群特征,通过分析女性性工一般女性人群阴道菌群的作者与CUP多样性W及菌群构成,并用LE巧e寻找两一组中有统计学差异的taxa,化较女性性工作者与般女性人群阴道菌群的差异。3、

7、探究阴道菌群随着月经周期的改变是否相对稳定。通过对月经周期阴道菌群的CUP多样性及和阴道菌群的稳定性和弹性分析,探讨随着月经周期改变阴道菌群的变化。研究方法!第一章20?2014年07月14年08月,招募在南方医科大学南方医院健康体检中也进行常规体检的女性志愿者,在常规妇科体检前,告知其研究方案及意义,得。到其同意并配合进行采样及相关信息问卷由经验丰富的妇产科医生,使用窥阴器撑开阴道一,在肉眼直视下,使用次性棉签拭子,采集后弯庭部位阴道分泌物,同时采集H个平行样品。按照入组标准和排除标准,巧纳入志愿者99人,-年齡19

8、52岁。采集的样品暂时存放于带有冰盒生

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