基于转录组测序的荆州黑麦基因组特异标记开发与染色体定位分析

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1、分巧号?淵学号20測1178?.為请泉達*參全日制专业学位硕壬学位论文基于转录组测序的荆州黑麦基因组特异标记开发与染色体定位分析了桃春指导教师开增军教授学位类别农业推广硕±专业名称作物.-r.'研究方向小麦分子细胞遗传学—VV.答辩日期二〇五年八月—\_'J..'式■'-■■,??《..?I:>■....■'A:DEVELOPMENTANDPHY別CALLOCALIZATIONOf-RYEGENOM

2、ESPECIFICMARKERSBASEDONTRANSCRIPTOMESEQUENCESOFSECALECEREALSByDingTaochunSupervisedbyProf.QiZengjunADissertationSubmittedtoNaninAriculturalUniversitjggy化PartialFulfiUment化化eRequirements化rMasterDegreeofAgriculturalScienceNaninAriculturalUniversitjgg

3、yAuust2015g,原创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均已在文中W明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者(需亲笔)签名:节)(弁5日了;^^学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版。,允许论文被査阅和借阅本人授权南京农业大学

4、可W将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可W、缩印或扫描等复制手段保存和汇编学位论文采用影印。保巧□,在年解密后适用本授权书;本学位论文属于不保密口。(请"。在W上方框内打V)学位论文作者(需亲笔)签名;1>,s年W曰巧)庵?导师(需亲笔)签名年月T日^目录目录摘要IABSTRACT阳一第部分文巧综巧11分子标记在小麦染色体工程中的应用11.1染色体工程的概念与意义11.2分子标记的类型与发展11.3基于NGS测序的分子标记开发与应用21.4分子标巧在小麦染色体工程中的应用4

5、1.4.1鉴定染色体部分同源性41.4.2用于小麦异染色体系的选育与鉴定.41.4.3外源抗病基因的追踪与辅助选择51.4.4外源抗性基因的精细定位与克隆5第二部分研究报告71材料与方法.......—71.1植物材料718.2来源于荆州黑麦的转录组序列相似性比较和引物设计1.3分子标记分析81.3DNA.1的提取81CR9.3.2P扩増及扩増产物的检测2结果与分析92.1百萨偃麦草ESTs标记在荆州黑麦中的可转移性分析92-.2基于RNAS巧的荆州黑麦基因组特异标记开发与染

6、色体定位102.2.1引物设计101基于转录组测序的荆州黑麦基因组将异标记开发与染色体定位分析2.2.2引物的扩增分析和荆州黑麦基因组特异标记的筛选112.2.3多态性标记在荆州黑麦染色体上的定位132.3荆州黑麦特异标记的应用分析20324-3.1基于RNAseq开发荆州黑麦特异标记的特点243.2荆州黑麦特异标记的染色体定位253.3荆州黑麦特异标记的应用潜力25全文结论27参教献29致巧35摘要基于转录组测序的荆州黑麦基因组特异标记开发与染色体定位分析摘要工

7、、优品种的重要途径。分子染色体程是拓宽小麦遗传基础,培育高产质和抗病"、入加快外源基因的转标记可有效追踪鉴定导到小麦背景中的外源染色体和片段,移利用和物理定位,为染色体工程的发展注入了新的活为。我国栽培黑麦品种荆州黑麦(庇ca/ecerea/eL.CV.Jingzhouheimai,JZHM)高抗白粉病、黄花叶病和纹枯病,在其染色体化和化上均发现抗白粉病基因,但是,由于这些染色体在巧有有利基因的同时还携带不利基因,因此培育仅具目标基因的小片段

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