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《桑树转录组测序及ssr标记的开发与鉴定》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、摘要摘要中国是世界丝绸业的发源地，蚕桑生产有着五千多年的悠久历史。桑叶作为家蚕仅有的食物来源，是生产蚕茧、生丝的物质基础。近年来，桑树不仅在传统蚕桑产业发挥着重要作用，而且桑树资源的综合利用也得到了迅速发展。桑树可用于防风固沙、园林绿化，桑叶可作为中药材及动物饲料，桑果可用于果汁果酒加工，桑枝桑根也是中药材的一种，桑树在多个产业中展现出巨大的开发潜力和经济效益。中国幅员辽阔，生态环境复杂，气候多变，桑树广泛分布在中国各地区。桑树因分布广泛，地理环境各异，在经过长期物种选择后形成了丰富多样的种质资源。随着分子生物学的发展，利用分子学的方法研究桑树种质成为了当
2、前热门的研究方向。本研究对桑树品种“抗青10号”的根和叶进行高通量转录组测序研究和生物信息学分析。基于转录组信息分析，开发和筛选SSR分子标记，为桑树核心种质的建立、遗传多样性分析、遗传图谱的构建等提供理论和技术支持。本文研究的主要结论如下：（1）通过对桑品种“抗青10号”根和叶进行Illumina高通量测序，共得到105,000,000个90bp的reads，拼接后获得60,069个Unigene，总长度为47.63Mb。所有的Unigene在Nr、GO、COG、Swissprot等已知蛋白库中进行比对，结果显示42,218个unigenes成功匹配，有
3、31,548个Unigene注释分为55个GO功能分类，7,790个是同源分类组，23,188个被分为128个生物代谢途径。功能分类的结果显示，大量基因参与次生代谢反应过程，尤其是黄酮类、萜类、生物碱的生物合成过程。（2）基于桑树转录组共开发了10,268个SSR分子标记，并根据其序列特征设计SSR引物。从中随机挑选出100对SSR引物进行PCR扩增验证实验，琼脂糖凝胶电泳结果显示87对引物可以扩增出产物。其中，58对引物扩增的片段大小与预期片段大小一致，26对引物扩增的片段长于预期片段，3对引物扩增的片段短于预期片段。进一步利用聚丙烯酰胺凝胶分析，结果显
4、示大多数引物扩增的条带数都是1，扩增条带数>2的引物所涵盖的SSR基序重复次数都>3。综上所述，利用转录组测序得到的EST数据库开发的EST-SSR引物是可行、高效的，可用于桑树遗传结构、遗传多样性分析及连锁图谱的构建。关键词：桑树；转录组测序；微卫星；开发I江苏科技大学农学硕士学位论文AbstractChinaisthebirthplaceoftheworld'ssilkindustry,andsericultureproductionhasfivethousandyearshistory.Themulberryleafactsasthesolefood
5、ofsilkworm,whichisthematerialbasisofcocoonsandsilkproduction.Inrecentyears,mulberrynotonlyplaysanimportantroleinthetraditionalsericultureindustry,butalsodevelopsrapidlyincomprehensiveutilizationofmulberryresource.Mulberrycanbeusedfordefensingwindandsand,landscaping;mulberryleavesc
6、anbeusedasherbalmedicinesandanimalfeed;mulberryfruitcanbeusedforfruitjuiceandwineprocessing;mulberrybranchandrootisoneoftheherbalmedicines,too.Inbrief,mulberryshowsgreatpotentialsandeconomicbenefitsinmanyindustries.Chinaisalargecountrywithdiverseecologicalenvironmentandclimatechar
7、acteristics,mulberryresourcedistributeswidelyinvariousregionsofChina.Becauseofitswidedistributionandhasdiversegeographicalenvironment,mulberryformsarichanddiversegermplasmresourceafteralongtimespeciesevolution.Recently,withthedevelopmentofmolecularbiology,researchinmulberrygermpla
8、smusingmolecularmethodshasbecomea
