稗草叶绿体基因组测序及其分子标记开发与利用

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时间:2019-03-13

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1、.JWi硕士学位论文中文论文题目:稗草叶绿体基因组测序及其分子标记开发与利用英文论文题目::巾沾人姓名:林张翔指导教邮:———专业学位类别:专业学位领±成:作所在学院:农业张物技术学院论文提交日期丨年!月分类号单位代码:密级学号:硕士学位论文中文论文题目:稗萆叶绿体基因组测序及其分子标记开发与利用英文论文题目:申请人姓名:林张翔指导教师:變龙江教授专业学位类别:农学硕士专业学位领域:作物学所在学院:农业与生物技术学院论文提交日期年月稗草叶绿体基因组测序及其分子标记开发与利用论文作者签名:指导教师签名:论文评阅人评阅人评阅人评阅人评阅人答辩委员会主席:委员委员委员後爷崎委员委

2、员答辩日期:二、⋯EchinochloachloroplastgenomesequencinganddevelopmentofmolecularmarkersAuthor'ssignature:LyvSupervisor'ssignature:Thesisreviewer1::::::::::浙江大学研宄生学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研宄成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研宄成果,也不包含为获得浙江大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的

3、任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名签字曰期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解浙江大学有权保留并向国家有关部门或机构送交本论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权浙江大学可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。保密的学份论文在解密后话用本将叔书)浙江大学硕士学位论文目录目录搬文献综述稗草简介叶绿体基因组学研宄叶绿体基因组结构及研宄现状叶绿体基因组测序技术进展叶绿体基因组在植物系统发育研宄中的应用材料与方法实验材料与数据实验方法物种鉴定稗草叶绿体基因

4、组分析稗属进化分析稗草叶绿体分子标记开发结果与分析物种鉴定表型鉴定系统进化分析叶绿体基因组拼接叶绿体基因组注释叶绿体基因组比较分析稗属分化时间估计稗草叶绿体分子标记开发隨硕士期间发表论文浙江大学硕士学位论文致谢致谢七年浙大梦,一生求是情。转眼间已在浙大学习生活了七年,在这美丽的求是园里,每一条路都有我的足迹,每一个角落都有我的回忆。时光匆匆,如白驹过隙,回想这三年的研究生生活有太多的收获、感动与不舍,在这即将毕业的时刻,我由衷的感谢一路走来给予我支持、鼓励与帮助的人。首先要感谢的是我的导师樊龙江教授。本课题能够顺利完成,离不开樊老师的谆谆教诲和悉心指导,在研究项目的选题、路

5、线设计、方案实施直至论文撰写等各个环节,樊老师都严格把关,投入了大量的时间和心血。樊老师在科研和生活上都给了我很大的帮助,他渊博的学识、严谨的治学态度、求真务实的科研精神和精益求精的工作作风都深深的影响了我,使我受益匪浅,让我在学习专业知识的同时也领会到了许多待人接物与为人处世的道理。其次,我要感谢本实验室的讲师叶楚玉、师兄桂毅杰、闫成海、刘扬、邱杰、王营营,师姐白雪菲、吴三玲,以及师弟师妹王卫娣、沈恩惠、法一飞、陈力、付菲、毛凌锋、褚琴洁、于勇一、刘晨等人在生物信息和实验方面提供的帮助,让我在这样一个温馨团结的大家庭中顺利的完成课题。感谢张海强在科研上的鼓励帮助和生活上的

6、悉心照顾,感谢他对我的包容和付出,与我共同分享快乐分担压力,陪我度过了一段别样精彩的研究生生活。感谢吴敏洁、季灵艳等每一位好朋友在生活上的关心和帮助。最后,我要感谢我亲爱的爸爸妈妈,感谢他们的养育之恩,感谢他们为我所付出的的一切,他们的支持和鼓励是我不断拼搏进取的动力源泉和精神支柱。值此论文即将完成之际,我谨向所有给予我关心、支持和帮助的老师、朋友、亲人,以及参加本次论文评阅和答辩的各位老师表达最诚挚的谢意!林张翔年月于浙大紫金港浙江大学硕士学位论文摘要摘要禾本科稗属包含大量能够导致作物产量减少的杂草,在全世界范围内广泛分布,形态复杂多样,分类鉴定較为困难。随着高通量测序技

7、术的发展,序列信息成为了物种研究和进化分析的基础,然而至今为止,稗属的序列信息仿然十分有限。本研究通过对稗属两个种水田稗和稗(新鲜绿色叶片进行高通量测序,利用叶绿体基因组序列的保守性进行稗草叶绿体拼接组装,获得了两条完整的稗草叶绿体基因组序列。此外,研究利用叶绿体基因组估算了稗属的分化时间,并开发了分子标记,为稗属的全基因组研究奠定了基础。具体结果如下:水田稗的叶绿体基因组长,,大单拷贝区(长小单拷贝区长反向重复区长,。稗的叶绿体基因运长,长,长,长。两条叶绿体基因组之间存在个插入缺失和个碱基替换位点,均包含蛋白编

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